#Mikrobiom #Xəbərlər

Alimlər bakterial yırtıcı zülalların “super ailəsini” aşkar ediblər

Elm adamları bakteriyalarda bu orqanizmlərin ətraf mühitlə necə qarşılıqlı əlaqəsi haqqında anlayışımızı dəyişdirə biləcək yeni bir protein növü müəyyən etdilər.

Nature Communications -da nəşr olunan yeni bir araşdırma , bakterial yırtıcı Bdellovibrio bacteriovorus-da tapılan PopA adlı zülal üzərində fokuslanır. Zülal, oxşar zülallarda görülən adi tək və ya üç hissəli strukturlardan fərqli olaraq unikal beşqat struktur meydana gətirir.

Birmingem Universitetinin alimlərinin rəhbərlik etdiyi beynəlxalq tədqiqat qrupu, PopA-nın bakteriya membranının hissələrini içərisində saxlaya bilən qaba bənzər bir formaya sahib olduğunu aşkar etmək üçün qabaqcıl görüntüləmə üsullarından istifadə etdi.

PopA – xarici membran zülalı (OMP) – E. coli bakteriyalarına daxil edildikdə, onların membranlarının zədələnməsinə səbəb olur. Bu, PopA-nın Bdellovibrio-nun digər bakteriyalara necə hücum etməsində və istehlak etməsində rol oynaya biləcəyini göstərir, eyni zamanda lipidləri (yağları) tutmaq qabiliyyəti bakteriyaların ətrafları ilə qarşılıqlı əlaqəsinin yeni bir yolunu təklif edir.

Struktur təhlili və süni intellektə əsaslanan axtarışlar göstərdi ki, müxtəlif bakteriya növlərində tapılan PopA homoloqları tetramerlər, heksamerlər və hətta qeyri-amerlər əmələ gətirir və bunların hamısı lipid tutma xüsusiyyətlərini bölüşür. Bu, geniş yayılmış, əvvəllər tanınmamış zülalların “superfamilyası”ndan xəbər verir.

Aparıcı müəllif, Birmingem Universitetindən professor Endryu Loverinq şərh etdi: “Bizim kəşfimiz əhəmiyyətlidir, çünki elm adamlarının bakterial zülallar haqqında bildiklərini şübhə altına alır. PopA-nın unikal strukturu və funksiyası bakteriyaların ətraf mühitlə qarşılıqlı əlaqədə əvvəllər başa düşüləndən daha mürəkkəb üsullara malik olduğunu göstərir.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=8188791252&adk=1645945215&adf=308666314&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1751951705&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-07-scientists-uncover-superfamily-bacterial-predator.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM4LjAuNzIwNC45NyIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJOb3QpQTtCcmFuZCIsIjguMC4wLjAiXSxbIkNocm9taXVtIiwiMTM4LjAuNzIwNC45NyJdLFsiR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzOC4wLjcyMDQuOTciXV0sMF0.&dt=1751951705306&bpp=1&bdt=107&idt=52&shv=r20250702&mjsv=m202507070101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1751951529%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1751951529%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3D1241933dda87baba%3AT%3D1750839581%3ART%3D1751951529%3AS%3DAA-AfjZwPuiSAour3k16ZA1JtXua&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=6251873307043&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=4&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=1968&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31093039%2C31093232%2C95353386%2C95362656%2C95363083%2C95365226%2C95365235%2C31093335%2C95365112%2C95359265%2C95365119%2C95365798%2C31092548%2C31061690&oid=2&pvsid=3209803098414677&tmod=999968100&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=2&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=180

“Bu, bakteriyaların necə fəaliyyət göstərdiyini və onların mühitləri ilə qarşılıqlı əlaqəsini başa düşmək üçün yeni imkanlar aça bilər – tibb və biotexnologiya üçün vacib təsirləri olan zərərli bakteriyaları hədəf almağın yeni yollarına səbəb ola bilər.”

Tədqiqat həmçinin bakteriya zülalları haqqında biliklərimizi daha da genişləndirən və halqalara birləşmə mexanizminin əvvəllər düşünüldüyündən daha geniş yayılmış ola biləcəyini irəli sürərək, halqaya bənzər strukturlar meydana gətirən başqa bir yeni zülal ailəsini müəyyən etdi.

Rentgen kristalloqrafiyası, krio-elektron mikroskopiya və molekulyar dinamikanın birləşməsindən istifadə edən komanda, əvvəllər Bd0427 kimi tanınan PopA-nın mərkəzi lipid tutma boşluğu əmələ gətirdiyini nümayiş etdirdi, çünki bu, membran zülalının əmələ gəlməsi dərslik modelinin dodaq zülalları istisna olmaqla mərkəzləşdiyini nəzərə alsaq, bu qeyri-adidir.

OMP-lər siqnal vermə, ev sahibi hüceyrənin yapışması, mühüm reaksiyaların katalizi və məhlulların/qida maddələrinin insan orqanizmində orqanellələrə və orqanoidlərə daşınması daxil olmaqla geniş funksiyaları yerinə yetirir. OMP-lərin təbii dəyişkənliyini başa düşmək antibakterial inkişafdan sintetik biologiyaya qədər üstünlüklərə malik ola bilər.

Ətraflı məlumat: Rebecca J. Parr et al, Bakterial yırtıcılar tərəfindən istifadə edilən porin kimi zülal daha geniş lipid tutma super ailəsini təyin edir, Nature Communications (2025). DOI: 10.1038/s41467-025-61633-0

Jurnal məlumatı: Nature Communications 

Birmingham Universiteti tərəfindən təmin edilmişdir 

Download QRPrint QR