#Araşdırmalar və Tədqiqatlar #Xəbərlər

Avropa kartofunun genomunun şifrəsi açıldı: Tədqiqatçılar böyük fərqlərə malik kiçik genofond tapırlar

Kartof 1,3 milyard insan üçün əsas qidadır. Lakin onların qlobal ərzaq təhlükəsizliyi üçün əhəmiyyətinə baxmayaraq, heyvandarlıq uğurları təvazökar olmuşdur. Ən məşhur kartof sortlarından bəziləri onilliklər əvvəl yetişdirilmişdir. Bu məhdud uğurun səbəbi kartofun mürəkkəb genomudur: hər hüceyrədə genomun iki əvəzinə dörd nüsxəsi var. Bu, ənənəvi hibridləşməyə əsaslanan yetişdirməni çətinləşdirir.

https://57219b655bc578deabada5330965cbc6.safeframe.googlesyndication.com/safeframe/1-0-41/html/container.html

LMU və Maks Plank Bitki Yetiştirmə Tədqiqatları İnstitutunun Genom Plastisitesi və Hesablama Genetikası tədqiqat qrupunun rəhbəri, professor Korbinian Schneebergerin rəhbərlik etdiyi komanda indi mühüm bir irəliləyiş əldə etdi. Tədqiqatçıların Nature jurnalında verdiyi məlumata görə, onlar on tarixi kartof sortunun genomunu yenidən qura biliblər . Daha sonra onlar bu biliklərdən kartof genomlarının yenidən qurulmasını daha asan və daha sürətli edəcək bir metod hazırlamaq üçün istifadə etdilər.

Wageningen Universiteti, Groß Lüsewitzdəki Leybniz Bitki Genetikası və Bitki Bitkiləri Tədqiqat İnstitutu (IPK) və Çinin Xi’an Jiaotong Universitetinin tədqiqatçıları ilə əməkdaşlıq edərək, qrup tarixi sortları seçdi, bəziləri artıq 18-ci əsrdə becərilmişdi.

Schneeberger deyir: “Bu kartoflar Avropada yetişdirmə proqramlarının başladığı dövrdən gəldiyi üçün biz kartoflarımızın genetik potensialını anlamaq üçün bu kartoflarda nə qədər müxtəlifliyin olduğunu anlamaq istədik”.

Cavab belə oldu: çox deyil. Kartofun genetik hovuzu son dərəcə məhduddur. On kartof sortları bütün müasir Avropa kartoflarının genetik dəyişkənliyinin təxminən 85%-ni əhatə edirdi.

Cənubi Amerikadan gətirildikdən sonra darboğaz təsirləri

Tədqiqatçılar əldə etdikləri nəticələri darboğaz təsirləri ilə əlaqələndirirlər. Kartof 16-cı əsrdən etibarən Cənubi Amerikadan gətirilirdi. Fərqli şəxslərin sayı az idi və əksəriyyəti Avropa şərtlərinin öhdəsindən gələ bilmirdi. Bu azalmış genofond daha sonra xəstəliklər tərəfindən daha da azaldıldı. Ən məşhur nümunə, 1840-cı illərdə məhsulun dağılmasına səbəb olan və xüsusilə İrlandiyada, həm də Avropanın qalan hissəsində fəlakətli qıtlıqlara səbəb olan kartofun gec zərərverici epidemiyasıdır.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=8188791252&adk=1645945215&adf=4054963813&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=100&lmt=1744865868&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-04-european-potato-genome-decoded-small.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM1LjAuNzA0OS45NSIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJHb29nbGUgQ2hyb21lIiwiMTM1LjAuNzA0OS45NSJdLFsiTm90LUEuQnJhbmQiLCI4LjAuMC4wIl0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzNS4wLjcwNDkuOTUiXV0sMF0.&dt=1744865868550&bpp=1&bdt=72&idt=65&shv=r20250410&mjsv=m202504140101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1744865844%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1744865844%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3Dcdf7f2f01784f52d%3AT%3D1735196613%3ART%3D1744865844%3AS%3DAA-Afjb8kbeupLLyQ0QHQmZxpM4v&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=5205641492527&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=4&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2276&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=95355972%2C95355974%2C95355501%2C95354562%2C95357460%2C31091783%2C95357877%2C31090357%2C95357716&oid=2&pvsid=1503210397135161&tmod=1416461313&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=69

Eyni zamanda, tədqiqat, tədqiqatçıların təəccübünə səbəb olaraq, fərdi xromosom nüsxələri arasındakı fərqlərin böyük ola biləcəyini ortaya qoydu. Schneeberger izah edir: ” Genofond çox məhdud olduğundan, çox fərqli xromosomlar yoxdur, lakin xromosomlar fərqli olduqda, onlar əvvəllər əhliləşdirilmiş bitkilərdə müşahidə olunmayan dərəcədə ayrılır”. “Fərqlər insanlardan təxminən iyirmi dəfə çoxdur.”

Bu fərqlər, ehtimal ki, kartofun Avropaya gəlməsindən əvvəl yaranıb. Cənubi Amerikanın yerli xalqları təxminən 10.000 il əvvəl kartofu əhliləşdirməyə başladılar və fərqlər çox güman ki, yabanı növlər arasında keçidin nəticəsidir.

Nəhayət, tədqiqatçılar Avropa İttifaqında qeydiyyatdan keçmiş 2000-ə yaxın kartofun genomlarını təhlil etmək üçün istifadə edilə bilən yeni bir yanaşma hazırladılar . Bir genomun yenidən qurulması üçün lazım olan məlumatları zəhmətlə yaratmaq əvəzinə, asanlıqla əldə edilən məlumatlar, məlum xromosomlardan hansının bir sortda mövcud olduğunu müəyyən etmək üçün hazırda məlum olan genomlarla müqayisə edilir. Tədqiqatçılar göstərdilər ki, onların yanaşması 1908-ci ildən mövcud olan və bu gün də kartof qızartması üçün standart çeşid olan Russet Burbank sortu ilə işləyir.

Schneeberger deyir: “Genom ardıcıllığı haqqında bilik ənənəvi seleksiyadan tutmuş genom mühəndisliyinin ən son üsullarına qədər bitki seleksiyasında bir çox yanaşmanın əsasını təşkil edir”. “Gələcəkdə biz artıq bu məlumat olmadan işləmək məcburiyyətində qalmayacağıq.”

Daha çox məlumat: Hequan Sun et al, Tetraploid Avropa kartofunun mərhələli pan-genomu, Təbiət (2025). DOI: 10.1038/s41586-025-08843-0

Jurnal məlumatı: Təbiət 

Münhen Ludwig Maximilian Universiteti tərəfindən təmin edilmişdir

Leave a comment

Sizin e-poçt ünvanınız dərc edilməyəcəkdir. Gərəkli sahələr * ilə işarələnmişdir