Arlinqtondakı Texas Universitetinin tədqiqatçıları alimlərə genlərin necə açılıb-sönməsinə nəzarət edən transkripsiya tənzimləyiciləri kimi tanınan zülalları təyin etməyə kömək edən yeni hesablama aləti hazırlayıblar.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=7587637799&adk=1434173251&adf=4198688998&pi=t.ma~as.7587637799&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1750225383&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fmedicalxpress.com%2Fnews%2F2025-06-bayesian-boosts-gene-accuracy.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM3LjAuNzE1MS4xMDQiLG51bGwsMCxudWxsLCI2NCIsW1siR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTA0Il0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTA0Il0sWyJOb3QvQSlCcmFuZCIsIjI0LjAuMC4wIl1dLDBd&dt=1750225380516&bpp=1&bdt=350&idt=147&shv=r20250616&mjsv=m202506110101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3De77740426f8da9bc%3AT%3D1735295852%3ART%3D1750225105%3AS%3DALNI_MbHbvhLj3WydQ3lYshQhNgDg8E9nQ&gpic=UID%3D00000f80ad9e2337%3AT%3D1735295852%3ART%3D1750225105%3AS%3DALNI_MYM9zSDwUrvOLsQ-H1E20L0IjGeMw&eo_id_str=ID%3D6293460226466de5%3AT%3D1735295852%3ART%3D1750225105%3AS%3DAA-AfjalIOi2w5hht07Vbs1rPFfC&prev_fmts=0x0%2C336x280&nras=1&correlator=7340090770300&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=1&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=1100&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31092114%2C31092885%2C31092959%2C95331833%2C95353386%2C95362656%2C95359265%2C31092985%2C95362798%2C95362802%2C95363074%2C31092674&oid=2&psts=AOrYGslOUgBRixSH4Hi4snEHiSde7pXoVNIfdvCcN6zhcb4cHXgB3n-c6IwG2Hmjbued1ZhWf4AQaClbh6yxrLsnk-kF1EjJ&pvsid=2165345062411640&tmod=123106159&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=2697

“Bu zülallar böyümə, inkişaf və xəstəlik də daxil olmaqla bir çox bioloji proseslərin mərkəzidir” dedi baş müəllif Xinlei (Şerri) Wang, Jenkins Garrett statistika və məlumat elmləri professoru .

Bu yaxınlarda Nature Communications -da nəşr olunan araşdırmada Dr. Vanq və onun həmkarları – UTA-da laboratoriyasında postdoktoral tədqiqatçı Zeyu Lu və UT Cənub-Qərb Tibb Məktəbinin tədqiqatçısı Lin Xu Epigenomics-based Sets və ya BIT Sorğudan Transkripsiya Tənzimləyicilərinin Bayesian İdentifikasiyası adlı aləti təqdim edirlər.

BIT çərçivəsi təcrid olunmuş məlumat hissələrini qiymətləndirməkdənsə, çoxsaylı sübut təbəqələri üzrə ehtimalları qiymətləndirən Bayes iyerarxik modelləşdirməsindən istifadə edir. Bu yanaşma alimlərə hətta birdən çox TR-nin eyni vaxtda aktiv ola biləcəyi mürəkkəb bioloji mühitlərdə belə transkripsiya tənzimləyicilərini və ya TR-ləri daha inamla müəyyən etməyə imkan verir.

Ayrı-ayrı TR-ləri ayrı-ayrılıqda təhlil etmək əvəzinə, BIT alimlərə hansı tənzimləyicilərin aktiv olduğu və onların necə fəaliyyət göstərdiyi barədə daha aydın təsəvvür yaratmaq üçün böyük həcmdə məlumatları birləşdirir. Bu, BIT-i transkripsiya tənzimləməsini öyrənmək üçün güclü bir vasitə halına gətirir.

TR-lər nasaz olduqda, onlar xərçəng də daxil olmaqla bir çox sağlamlıq problemlərinə kömək edə bilər, Wang dedi.

“Mənim kimi tədqiqatçılar uzun müddətdir ki, hansı TR-lərin xüsusi bioloji şəraitdə aktiv olduğunu dəqiq müəyyən etmək üçün mübarizə aparırlar, çünki ənənəvi üsullar qeyri-dəqiq ola bilən DNT-dəki bağlama motivləri kimi markerlərə əsaslanır” dedi. “Tədqiqatımız bu zülalları daha dəqiq və şərh edilə bilən şəkildə müəyyən etmək üçün epigenomik məlumatların geniş kitabxanasından istifadə edərək daha təkmil bir yanaşma təklif edir.”

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=7099578867&adk=1328126233&adf=1100001614&pi=t.ma~as.7099578867&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1750225383&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fmedicalxpress.com%2Fnews%2F2025-06-bayesian-boosts-gene-accuracy.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM3LjAuNzE1MS4xMDQiLG51bGwsMCxudWxsLCI2NCIsW1siR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTA0Il0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTA0Il0sWyJOb3QvQSlCcmFuZCIsIjI0LjAuMC4wIl1dLDBd&dt=1750225380517&bpp=1&bdt=351&idt=147&shv=r20250616&mjsv=m202506110101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3De77740426f8da9bc%3AT%3D1735295852%3ART%3D1750225105%3AS%3DALNI_MbHbvhLj3WydQ3lYshQhNgDg8E9nQ&gpic=UID%3D00000f80ad9e2337%3AT%3D1735295852%3ART%3D1750225105%3AS%3DALNI_MYM9zSDwUrvOLsQ-H1E20L0IjGeMw&eo_id_str=ID%3D6293460226466de5%3AT%3D1735295852%3ART%3D1750225105%3AS%3DAA-AfjalIOi2w5hht07Vbs1rPFfC&prev_fmts=0x0%2C336x280%2C750x280&nras=1&correlator=7340090770300&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=1&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2262&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31092114%2C31092885%2C31092959%2C95331833%2C95353386%2C95362656%2C95359265%2C31092985%2C95362798%2C95362802%2C95363074%2C31092674&oid=2&psts=AOrYGslOUgBRixSH4Hi4snEHiSde7pXoVNIfdvCcN6zhcb4cHXgB3n-c6IwG2Hmjbued1ZhWf4AQaClbh6yxrLsnk-kF1EjJ&pvsid=2165345062411640&tmod=123106159&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=3&uci=a!3&btvi=2&fsb=1&dtd=2702

BIT-nin ən perspektivli tətbiqlərindən biri xərçəng tədqiqatlarıdır . Şişin sağ qalması üçün vacib olan TR-ləri müəyyən etməklə, elm adamları xərçəng hüceyrələrində potensial zəif nöqtələri aşkar edə bilərlər. Bu bilik, şiş böyüməsini dayandırmaq üçün xüsusi TR-ləri hədəf alan yeni müalicə strategiyalarına səbəb ola bilər.

“Bu irəliləyiş əhəmiyyətlidir, çünki TR-lər insan sağlamlığının bir çox aspektlərinə təsir göstərir və hansının aktiv olduğunu müəyyən etmək xəstəliklər və potensial müalicələr haqqında daha dərin məlumat verə bilər” dedi Wang. “Məsələn, xərçəngdə nizamsız TR-lər nəzarətsiz hüceyrə artımına səbəb ola bilər ki, bu da şişlərə səbəb ola bilər. Bu prosesdə hansı TR-lərin iştirak etdiyini bilmək tədqiqatçılara normal hüceyrə funksiyalarını qoruyarkən zərərli TR fəaliyyətini bloklayan məqsədyönlü müalicələr hazırlamağa kömək edə bilər.”

Xərçəngdən başqa, BİT həm də metabolik pozğunluqlar , ürək xəstəlikləri və transkripsiya tənzimlənməsinin mühüm rol oynadığı digər şərtlərlə bağlı araşdırmalara kömək edə bilər . TR bioloji funksiyaların geniş spektrinə təsir göstərdiyinə görə, onları daha dərindən başa düşmək tibbin bir çox sahələrində irəliləyişlərə səbəb ola bilər.

“BIT-nin inkişafı maşın öyrənməsinin və qabaqcıl statistik metodların müasir biotibbi tədqiqatlarda nə qədər güclü hala gəldiyini vurğulayır” dedi dissertasiya məsləhətçisi Vanq olan Dr. “Daha çox elm adamı mürəkkəb genetik və epigenomik məlumatları təhlil etmək üçün hesablama alətlərinə müraciət etdikcə, BIT kimi modellər yeni bioloji anlayışları aşkar etmək üçün vacib olacaq.”

Lu bildirib ki, kritik tənzimləyiciləri inamla müəyyən etmək qabiliyyətini təkmilləşdirməklə, BIT tədqiqatçılara xam epigenomik məlumatlar və mənalı kəşflər arasındakı boşluğu aradan qaldırmağa kömək edir. Bu, xəstəliklərin tədqiqatında, dərmanların hazırlanmasında və hətta fərdiləşdirilmiş tibbdə elmi nailiyyətləri sürətləndirə bilər.

Daha çox məlumat: Zeyu Lu və digərləri, BIT: Epigenomikaya əsaslanan sorğu bölgəsi dəstlərindən Transkripsiya tənzimləyicilərinin Bayesian İdentifikasiyası, Nature Communications (2025). DOI: 10.1038/s41467-025-60269-4

Jurnal məlumatı: Nature Communications Arlingtondakı Texas Universiteti tərəfindən təmin edilmişdir