Texas Universiteti MD Anderson Xərçəng Mərkəzi tərəfindən

Robert Egan tərəfindən redaktə edilmişdir

 Redaktorların qeydləriQrafik abstrakt. Kredit: Molekulyar Hüceyrə (2025). DOI: 10.1016/j.molcel.2025.10.010

Texas Universitetinin MD Anderson Xərçəng Mərkəzinin tədqiqatçıları göstəriblər ki, nukleosomun daxilində DNT-nin əyilməzliyi və ya sərtliyi INO80-in yerləşdirilməsini tənzimləyir. Bu, yalnız genetik məlumatın deyil, DNT-nin fiziki quruluşunun və formasının DNT transkripsiyasının əsas komponentləri olduğunu vurğulayır.

Molekulyar Hüceyrə jurnalında dərc olunan tədqiqata Epigenetika və Molekulyar Karsinogenez professoru, Ph.D. Blaine Bartholomew və Ph.D Şaqun Şukla rəhbərlik edirdi.

INO80 DNT ilə necə qarşılıqlı əlaqədə olur

“Biz xromatin və xromosomların tikinti blokları olan nukleosomları yerləşdirmək üçün INO80-in diqqətəlayiq spesifikliyini aşkar etdik ki, bu, çox çevik olmayan DNT tərəfindən dayandırılması ilə bağlıdır. Yenidən modelləşdirmə zamanı anlıq görüntülər alaraq, genomun bu spesifik bölgələri tərəfindən bloklanan nukleosomların hərəkətindəki addımları müəyyən edə bildik” dedi Barth.

INO80 və onun alt bölmələrinin mutasiyaları, silinməsi və həddindən artıq ifadəsi ürək xəstəliyi və xərçənglə əlaqələndirilir. INO80-in DNT transkripsiyasına və təmirinə necə təsir etdiyini başa düşmək, genlərin tənzimlənməsi və hüceyrə diferensiasiyası kimi kritik proseslərə dair fikirlər verir. INO80 və onun alt bölmələrinin öyrənilməsi xərçəng və digər xəstəliklər üçün terapevtik strategiyaların inkişafı üçün potensial hədəfləri müəyyən etməyə kömək edir.

DNT çevikliyinin rolu

DNT transkripsiyası zülalların qurulması üçün vacib olan gen ifadəsində ilk addımdır. Transkripsiya DNT-nin möhkəm sarılmış hissələrinin açılmasını nəzərdə tutur ki, molekullar nüsxə yaratmaq üçün müəyyən genlərə daxil ola bilsinlər.

INO80 xromatin remodeling kompleksi DNT-nin nukleosomlar adlanan komplekslər ətrafında necə qablaşdırıldığını idarə edir, lazım olduqda onu əlçatan edir, lazım olmayanda isə gizlədir. INO80-in nukleosomları necə hərəkət etdirdiyini başa düşmək vacibdir, çünki o, DNT transkripsiyası, təmiri və replikasiyası kimi hüceyrə proseslərində mühüm komponentdir.

Ardıcıllığı və ya quruluşuna görə normal olaraq sərt və əyilməyə davamlı olan əyilməz DNT-nin INO80-in bu nukleosomları hərəkət etdirməsinə mane olduğu düşünülürdü, lakin indiyə qədər göstərilməmişdir. Bu prosesin necə baş verdiyi haqqında az şey məlum idi.

Nukleosomların hərəkətinin unikal mexanizmi

Əksər xromatin remodeling zülalları nukleosomları eyni anda bir və ya iki DNT əsas cütünün qısa uzunluğunda hərəkət etdirir. Tədqiqatçılar aşkar etdilər ki, INO80 20-30 DNT əsas cütünün daha böyük uzantılarını nukleosomun nüvəsindən uzaqlaşdıran, onun nukleosom ətrafında dalğa kimi hərəkət etməsinə imkan verən döngələr və ya qabarıqlıqlar yaradan unikal mexanizmdən istifadə edir.

Tədqiqatçılar müəyyən ediblər ki, nukleosomun içindəki bu əyilməz DNT onun hərəkətini dayandırır, ilgəklərin və ya qabarıqların əmələ gəlməsinə mane olur və INO80-in özünü nukleosomların səthində düzgün yerdə yerləşdirməyə imkan verir.

Maraqlıdır ki, Bartholomew laboratoriyası əvvəllər göstərdi ki, INO80-in alt bölməsi olan Arp5 dinamik şəkildə fırlanır və bununla da Arp5-in nukleosomla təmasda olan bölgəsini dəyişir. Tədqiqatçılar, elastik olmayan DNT-yə bağlandıqda, Arp5-in bəzi qarşılıqlı təsirlərinin itirildiyini, yəni INO80-in nukleosomu dəyişdirə bilməyəcəyini qeyd etdilər.

Bu tapıntılar Arp5 alt bölmələrinin DNT-nin formasından asılı olaraq INO80 remodelingini tənzimləyən sensorlar kimi çıxış edə biləcəyini göstərir.

Daha çox məlumat: Shagun Shukla et al, nukleosomun içərisində DNT əyilmə qabiliyyəti INO80-in nukleosom yerləşdirilməsini tənzimləyir, Molecular Cell (2025). DOI: 10.1016/j.molcel.2025.10.010

Jurnal məlumatı: Molecular Cell 

Texas Universiteti MD Anderson Xərçəng Mərkəzi tərəfindən təmin edilmişdir