#Mikrobiom #Xəbərlər

Kinaz fermentləri həyat ağacı boyunca mövcuddur – bakteriyalarda olanlar yeni antibiotiklər üçün həssas hədəflər ola bilər.

Delthia Ricks tərəfindən , Phys.org

Gaby Clark tərəfindən redaktə edilmişdir , Andrew Zinin tərəfindən nəzərdən keçirilmişdir

 Redaktorların qeydləribSTK-lara xas olan qorunan struktur xüsusiyyətlər. Kredit: Elm Siqnallaşdırma (2025). DOI: 10.1126/scisignal.adt8686

Kinazlar kimi tanınan fermentlər yosunlardan tutmuş helmintlərə və məməlilərə qədər həyat ağacında çoxlu orqanizmlərdə hüceyrə böyüməsi, maddələr mübadiləsi və siqnalizasiyada mühüm rol oynayır. İndi elm adamları bakterial kinazaların atlası hazırlayıblar və onların yeni kompendiumunun yenidən işlənmiş antimikrob dərmanlar üçün mümkün hədəflər toplusunu ehtiva etdiyini söyləyirlər.

Corciya Universitetində tədqiqatçılar qrupu çox sayda bakterial növdə hüceyrə artımının və patogenliyin tənzimləyiciləri olan serin-treonin kinazları sıfıra endiriblər. Onlar deyirlər ki, onların məcmuəsi bakterial virulentlik və serin-treonin kinazların fəaliyyətini maneə törətməklə bakteriyalara hücum etməyin potensial yollarını araşdırmaq üçün təlimat verə bilər. Komandanın məcmuəsi 26 000-ə yaxın bakteriya ştammında serin-treonin kinazlarının təhlili ilə hazırlanıb.

“Bakteriya serin-treonin kinazları hüceyrə böyüməsi , virulentliyi və patogenliyi ilə bağlı müxtəlif hüceyrə proseslərini tənzimləyir və təkamül yolu ilə dərman qəbul edilə bilən eukaryotik serin-treonin kinazları ilə əlaqəlidir” deyə Corciya Universitetinin tədqiqatçısı Dr. Brady O’Boyle yazır. O’Boyle və komandası müəyyən etdi ki, bakteriya genomlarında serin-treonin kinazaların sayı Escherichia coli-də 1-dən bəzi Aktinobakteriya növlərində 60-dan çox dəyişir.

İnsanlar eukariotlardır və tibb tədqiqatçıları uzun müddətdir ki, insanlarda və digər məməlilərdə tapılan geniş fermentlər ailəsi olan narkotik maddə olan serin-treonin kinazlarından istifadə ediblər. Bir çox serin-treonin kinazlar xəstəliklərdə iştirak edir, fermentləri ideal dərman hədəfləri edir. Məsələn, mTOR inhibitorları kimi tanınan dərmanlar serin-treonin modulyatorlarıdır. Böyrək xərçəngi dərmanı everolimus, serin-treonin kinaz fəaliyyətini maneə törədən bir mTOR dərmanıdır.

Atlasın qurulmasında tədqiqatçılar Hanks tipli serin-treonin zülal kinazalarına etibar etdilər, tez-tez sadəcə olaraq serin-treonin kinazaları və ya sadəcə protein kinazaları adlandırıldılar. O’Boyle və həmkarları yazır ki, bu fermentlər maddələr mübadiləsi, hüceyrə siqnalı , zülalların tənzimlənməsi, hüceyrə daşımaları, ifrazat prosesləri və digər hüceyrə yollarında mühüm rol oynayan böyük bir ailənin bir hissəsidir .

Bioloji sistemlərdə serin-treonin kinazların xüsusi bir işi var: zülal zəncirində amin turşuları olan serin və treonini fosforlaşdırmaq. Fosforlaşma adətən adenozin trifosfatdan (ATP) bir serin və ya treonin qalığına fosfat qrupunun əlavə edilməsinə aiddir və bununla da protein funksiyalarını tənzimləyir.

Serin-treonin kinazları əhatə edən fosforlaşma həyat ağacında tapılan bioloji tənzimləmənin geniş yayılmış formasıdır. Bakteriyalara yeni bir şəkildə hücum etmək üçün O’Boyle və həmkarları orqanizmləri yatıra bilən və dərman müqavimətinin nəticələrinin qarşısını ala biləcək dərmana çevrilə bilən serin-treonin kinaz yerlərində hərəkət etməyi təklif edirlər.

“Science Signaling ” jurnalında O’Boyle və həmkarları yüz minlərlə bakterial serin-treonin kinazlarını necə təhlil etdiklərini və katalitik sahələrindəki ortaq oxşarlıqlara əsaslanaraq onları kinaz və psevdokinaz ailələrinə necə təsnif etdiklərini ətraflı şəkildə bildirirlər.bSTK ailələri məhdudiyyətə əsaslanan ardıcıllıq klasterləşdirmə təhlili ilə müəyyən edilmişdir. Kredit: Elm Siqnallaşdırma (2025). DOI: 10.1126/scisignal.adt8686

O’Boyle yazdı: “Bakteriya serin-treoninin eukaryotik həmkarlarından necə fərqləndiyini və müxtəlif bakterial siqnal funksiyalarını tənzimləmək üçün necə təkamül etdiklərini daha dərindən başa düşmək yeni antibiotik terapiyalarının kəşfi və inkişafı üçün çox vacibdir”.

Gündəlik anlayışlar üçün Phys.org-a etibar edən 100.000-dən çox abunəçi ilə elm, texnologiya və kosmosda ən son yenilikləri kəşf edin . Pulsuz xəbər bülleteni üçün qeydiyyatdan keçin və mühüm nailiyyətlər, yeniliklər və tədqiqatlar haqqında gündəlik və ya həftəlik yeniləmələr əldə edin .

Komanda 300.000-dən çox bakterial serin-treonin kinaz ardıcıllığını Milli Biotexnologiya İnformasiya Mərkəzinin lazımsız protein verilənlər bazalarının istinad ardıcıllığından (RefSeq) təsnif etdi.

Artıq O’Boyle və əməkdaşları vərəm bakteriyasına qarşı yeni üsulla kompendiumdan istifadə etməyin bir yolunu görürlər. Biokimyəvi və peptid kitabxanası ekranları serin-treonin fermentativ fəaliyyətinin inhibə edilməsinin Mycobacterium tuberculosis-ə nəzarət etmək üçün bir yol ola biləcəyini təklif etdi.

Ümumilikdə, tapıntılar hüceyrə siqnalında bakterial serin-treonin kinaz funksiyalarını araşdırmaq və seçici bakterial serin-treonin kinaz inhibitorlarını inkişaf etdirmək üçün əvvəllər naməlum yollar açır. Nəhəng kompendium bölmələri və başlıqları olan kitab kimi oxunur, onun tərtibatçıları atlasın xüsusi bakteriyalar və ferment qruplarını öyrənən tədqiqatçılara kömək edəcəyini vurğulayırlar.

O’Boyl qeyd etdi: “Fermentlər qorunan katalitik domendə və yan tənzimləyici domenlərdə təkamül məhdudiyyətlərinin nümunələri əsasında 35 kanonik və yeddi psevdokinaz ailəsinə bölündü”.

“Statistik müqayisələr vasitəsilə bakterial serin-treonin kinazları eukaryotik serin-treonin kinazlardan fərqləndirən xüsusiyyətləri müəyyən etdik, o cümlədən kinaz domeninin ATP və substratı bağlayan loblarını dinamik şəkildə birləşdirən tənzimləyici sarmalda (C spiral) arginin qalığı.”

Atlas mahiyyətcə bu minlərlə fermenti müxtəlif ailələrə təsnif etsə də, kinazın təkamülünün öyrənilməsinə məlumat verə biləcək bir mənbə də təqdim edir. Bununla belə, onun tərtibatçılarının fikrincə, ən böyük potensial dərman müqavimətində böhranı həll etməyə kömək etmək potensialına əsaslanır.

“Bu yazıda təqdim etdiyimiz struktur və tənzimləyici xüsusiyyətlər […] geniş spektrli [bakterial serin-treonin kinaz] hədəf alan antimikrobiyal dərmanların inkişafını məlumatlandırmaq üçün istifadə edilə bilər” O’Boyle və həmkarları yekunlaşdırdılar.

Sizin üçün müəllifimiz Delthia Ricks tərəfindən yazılmış , Gaby Clark tərəfindən redaktə edilmiş və Endryu Zinin tərəfindən yoxlanılmış və nəzərdən keçirilmiş bu məqalə diqqətli insan əməyinin nəticəsidir. Müstəqil elmi jurnalistikanı yaşatmaq üçün sizin kimi oxuculara güvənirik. Bu hesabat sizin üçün əhəmiyyət kəsb edirsə, lütfən, ianə (xüsusilə aylıq) nəzərdən keçirin. Siz təşəkkür olaraq reklamsız hesab əldə edəcəksiniz .

Daha çox məlumat: Brady O’Boyle et al, Bakterial serin-treonin kinazaların atlası funksional müxtəlifliyi və eukaryotik kinazalardan əsas fərqləri ortaya qoyur, Elm Siqnallaşdırma (2025). DOI: 10.1126/scisignal.adt8686

Jurnal məlumatı: Science Signaling 

© 2025 Science X Network

Download QRPrint QR