COVID pandemiyası, koronavirus infeksiyalarını müalicə edə bilən antiviral dərmanlara nə qədər təcili ehtiyacımız olduğunu göstərdi. Bu səyə kömək etmək üçün tədqiqatçılar tez bir zamanda SARS-CoV-2-nin NiRAN domeni kimi tanınan molekulyar strukturunun bir hissəsinə – bir çox koronaviruslar üçün ümumi olan viral replikasiya üçün vacib olan bir ferment bölgəsinə daxil oldular.

NiRAN domenini hədəf alan bir dərman, çox güman ki, bu patogenlərin sırasını bağlamaq üçün geniş şəkildə işləyəcək, potensial olaraq COVID kimi məlum xəstəlikləri müalicə edəcək, həmçinin əlaqəli virusların yaratdığı gələcək pandemiyaların qarşısını almağa kömək edəcəkdir.

2022-ci ildə Çin alimləri ( Yan və digərləri ) bu domenin necə işlədiyini təsvir edən struktur modeli dərc etdilər. Bu, dərman hazırlayanlar üçün böyük bir nemət olmalı idi.

Amma model səhv idi.

Rokfellerdə Seth A. Darst və Elizabeth Campbell laboratoriyalarının məzunu Gabriel Small, “Onların işində kritik səhvlər var” deyir. “Məlumatlar onların nəticələrini dəstəkləmir.”

İndi Cell -də nəşr olunan yeni araşdırmada Small və həmkarları elm adamlarının NiRAN domeninin necə işlədiyini niyə hələ də bilmədiklərini dəqiq nümayiş etdirirlər. Tapıntılar, artıq qüsurlu fərziyyələrə əsaslanaraq antiviral preparatların layihələndirilməsi üzərində çalışan dərman tərtibatçıları üçün geniş təsir göstərə bilər və ciddi yoxlamanın vacibliyini vurğulayır.

Molekulyar Patogenez Laboratoriyasının rəhbəri Kempbell deyir ki, “quruluşların dərman kimyası üçün dəqiq olması tamamilə vacibdir , xüsusən də sənayedə bu qədər sıx maraq doğuran antiviral dərmanlar üçün kritik hədəfdən danışarkən. “Ümid edirik ki, işimiz tərtibatçıların səhv bir quruluş ətrafında bir dərmanı optimallaşdırmaq cəhdlərinin qarşısını alacaq.”

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=8188791252&adk=1645945215&adf=308666314&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1751609266&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-07-team-flawed-relevant-coronavirus-antiviral.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM3LjAuNzE1MS4xMjAiLG51bGwsMCxudWxsLCI2NCIsW1siR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTIwIl0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTIwIl0sWyJOb3QvQSlCcmFuZCIsIjI0LjAuMC4wIl1dLDBd&dt=1751609266861&bpp=1&bdt=107&idt=31&shv=r20250630&mjsv=m202507020101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1751609113%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1751609113%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3D1241933dda87baba%3AT%3D1750839581%3ART%3D1751609113%3AS%3DAA-AfjZwPuiSAour3k16ZA1JtXua&prev_fmts=0x0%2C336x280%2C336x280%2C1200x280&nras=1&correlator=8184694227663&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=3&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2045&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31084128%2C95353386%2C95362655%2C95365225%2C31093300%2C95365107%2C95359266%2C95365120&oid=2&pvsid=7890108969880531&tmod=947375100&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fpage2.html&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=3&fsb=1&dtd=148

Perspektivli aparıcı

Orijinal məqalə Cell- də nəşr olunana qədər Campbell və Darst laboratoriyaları NiRAN domeni və onun terapevtik hədəf kimi əhəmiyyəti ilə artıq tanış idilər. Hər iki laboratoriya patogenlərdə gen ifadəsini öyrənir və onların SARS-CoV-2 üzərindəki işi qismən viral replikasiyanı koordinasiya edən molekulyar qarşılıqlı təsirləri xarakterizə etməyə yönəlib.

NiRAN domeni SARS-CoV-2 və digər koronaviruslara RNT-lərini örtməyə kömək etmək üçün vacibdir ki, bu da bu virusların çoxalmasına və sağ qalmasına imkan verir. Bu prosesin bir versiyasında NiRAN domeni virusun RNT-nin başlanğıcına qoruyucu qapaq taxmaq üçün GDP adlı molekuldan istifadə edir.

Kiçik daha əvvəl bu prosesi ətraflı təsvir etmiş və onun strukturu həll edilmiş hesab edilmişdir. Lakin NiRAN domeni qoruyucu qapaq yaratmaq üçün əlaqəli molekuldan, GTP-dən də istifadə edə bilər. NiRAN domenini hərtərəfli bağlayan antiviral dərmanlar hazırlamağa qərar verən elm adamları sonuncu GTP ilə əlaqəli mexanizmin təfərrüatlarını kəşf etməyə can atırdılar.

2022-ci il məqaləsində tədqiqatçılar su molekulunun RNT-nin 5′ fosfat ucunu buraxmaq üçün bir əlaqəni qırması ilə başlayan kimyəvi addımlar zəncirini təsvir etdilər. Bu uc daha sonra GTP molekulunun beta-fosfat ucuna yapışır, o, başqa bir fosfatı çıxarır və maqnezium ionunun köməyi ilə GTP molekulunun qalan hissəsini RNT-yə ötürür və virusun çoxalmasına və inkişaf etməsinə imkan verən qoruyucu qapaq əmələ gətirir.

Komandanın sübutu? Prosesin hərəkətdə olduğunu göstərən krio-elektron mikroskopiya görüntüsü. Bu katalitik ara məhsulu dondurmaq üçün komanda GMPPNP adlı GTP mimikindən istifadə etdi.

Kiçik kağızı maraqla oxuyur. “Onlar dərc edən kimi mən onların məlumatlarını endirməyə getdim” deyir. Orada deyildi. Bu, qırmızı bayraq qaldırdı – məlumatlar, ümumiyyətlə, struktur biologiya sənədi buraxıldıqdan sonra mövcuddur. Ancaq aylar sonra, nəhayət, Small məlumatlara daxil ola bildikdə, o, əhəmiyyətli qüsurları üzə çıxarmağa başladı. “Mən onların məlumatlarından istifadə edərək rəqəm yaratmağa çalışdım və ciddi problemlərin olduğunu başa düşdüm” deyir. Small öz narahatlığını Campbell və Darst-a çatdırdı.

Razılaşdılar. “Bir şey aydın deyildi” dedi Kempbell. “Ancaq biz digər komandaya şübhənin faydasını vermək və onların bütün məlumatlarını özümüz təkrar emal etmək qərarına gəldik.”

Gündəlik anlayışlar üçün Phys.org-a etibar edən 100.000-dən çox abunəçi ilə elm, texnologiya və kosmosda ən son yenilikləri kəşf edin . Pulsuz xəbər bülleteni üçün qeydiyyatdan keçin və mühüm nailiyyətlər, yeniliklər və tədqiqatlar haqqında gündəlik və ya həftəlik yeniləmələr əldə edin .Abunə ol

Yoxuş döyüş

Bu, zəhmətli bir iş idi, kiçik işlərə rəhbərlik edirdi. Çərçivə-kadr işləyərək, nəşr edilmiş atom modelini faktiki krio-EM xəritəsi ilə müqayisə etdi və təəccüblü bir şey tapdı: Yan və həmkarlarının gördüklərini iddia etdiyi əsas molekullar – xüsusən də GTP GMPPNP-ni və NiRAN domeninin aktiv yerindəki maqnezium ionunu təqlid edir – sadəcə orada deyildi.

Nəinki dəstəkləyici təsvir məlumatları yox idi, həm də bu molekulların orijinal modeldə yerləşdirilməsi də kimyanın əsas qaydalarını pozaraq, ciddi atom toqquşmalarına və qeyri-real yük qarşılıqlı təsirlərinə səbəb oldu. Kiçik əlavə testlər apardı, lakin nadir hissəcikləri seçmək üçün hazırlanmış qabaqcıl üsullar belə boş çıxdı. Yan və həmkarları tərəfindən əvvəllər istehsal edilən modeli dəstəkləmək üçün heç bir sübut tapa bilmədi.

Rokfeller tədqiqatçıları öz nəticələrini təsdiq etdikdən sonra öz tapıntılarını Cell -ə ​​təqdim etdilər . “Bizim düzəldici əlyazmamızı orijinal modeli dərc edən eyni jurnalda dərc etməyimiz çox vacib idi” deyən Campbell, aşağı səviyyəli jurnallarda dərc olunduqda yüksək profilli məqalələrə edilən düzəlişlərin çox vaxt diqqətdən kənarda qaldığını qeyd edir.

Əks təqdirdə, sahədəki bu çaşqınlıq laboratoriya skamyasından çox kənara çıxan problemlərə səbəb ola bilər, Campbell əlavə edir – ciddi əsas biotibbi tədqiqatların təkcə akademik deyil, həm də real dünyada tərəqqi üçün vacib olduğunu xatırladan bahalı bir xatırlatma. “Şirkətlər kartlarını sinələrinə yaxın saxlayırlar, lakin biz bilirik ki, bir neçə sənaye qrupu bunu öyrənir” dedi. “Qüsurlu struktur modelinə əsaslanan səylər illərlə vaxt və resurs itkisi ilə nəticələnə bilər”.

Daha çox məlumat: Gabriel I. Small et al, SARS-CoV-2 NiRAN domeni ilə GTP vasitəçiliyi ilə RNT-nin bağlanması mexanizmi həll edilməmiş qalır, Cell (2025). DOI: 10.1016/j.cell.2025.05.044

Jurnal məlumatı: Cell 

Rokfeller Universiteti tərəfindən təmin edilmişdir