Taylor Barnes, Baylor Tibb Kolleci

Gaby Clark tərəfindən redaktə edilmişdir , Andrew Zinin tərəfindən nəzərdən keçirilmişdir

 Redaktorların qeydləriQrafik Abstrakt. Kredit: Nuklein turşularının tədqiqatı (2025). DOI: 10.1093/nar/gkaf624

Genetik cəhətdən eyni olan “agouti canlı sarı” (A ^vy ) siçanları arasında bəziləri qəhvəyi və arıq, digərləri isə sarı və kökdür. Bu fərqlər, müxtəlif hüceyrə tiplərində gen ifadəsini təyin etmək üçün inkişaf zamanı DNT-yə əlavə edilən metil qrupları kimi molekulyar etiketlər sistemi olan epigenetikaya bağlıdır. 2003-cü ildə aparılan bir araşdırma göstərdi ki, hamiləlikdən əvvəl və hamiləlik zamanı dişi siçanların pəhrizini sadəcə olaraq “metil donor” qidaları ilə əlavə etmək onların A ^vy nəslinin daha çox arıq və qəhvəyi olmasına səbəb olub.

A ^vy geni “metastabil epiallel” kimi tanınır, çünki onun DNT metilasiya səviyyəsi erkən embrionun inkişafı zamanı təsadüfi olaraq müəyyən edilir. 2003-cü il tədqiqatı metastabil epialellərin siçanlarda ümumi ola biləcəyi fikrini gündəmə gətirərək, doğma siçanlar arasında izah olunmayan variasiyanın bir çox nümunəsi (məsələn, yüksək yağlı pəhrizdə çəki artımındakı fərqlər ) üçün potensial izahat təklif etdi. Bir neçə kiçik araşdırmaya baxmayaraq, siçanlarda metastabil epialellərin sayı 20 ildən çox müddət ərzində naməlum olaraq qaldı.

İndiyə qədər.

Pediatriya-qidalanma professoru və USDA/ARS Uşaq Qidalanma Tədqiqat Mərkəzinin və Baylor Tibb Kollecindəki Dan L Dunkan Kompleks Xərçəng Mərkəzinin üzvü, müvafiq müəllif Dr. Robert A. Waterlandın başçılıq etdiyi tədqiqatçılar qrupu tərəfindən aparılan yeni bir araşdırma indi siçanlarda metastabil epialellərin olduqca nadir olduğunu göstərir. Tədqiqat Nucleic Acids Research jurnalında dərc olunub .

Tədqiqat metastabil epialellərin qəti xüsusiyyətinə yönəldilib: DNT metilasiyasında sistemli fərdlərarası variasiya, yəni fərdin müxtəlif toxumalarında ardıcıl olan, lakin fərdlər arasında dəyişən metilasiya.

Bioinformatics Laboratoriyasının birinci müəllifi Dr. Chathura J. Gunasekara, “Biz bütün siçan genomunda epigenetik variasiyanın hərtərəfli, qərəzsiz skanını həyata keçirdik, üç fərqli toxumada – qaraciyər, böyrək və beyində – genetik cəhətdən eyni olan on siçanın hər birində DNT metilasiya nümunələrini analiz etdik” dedi. “Milyonlarla potensial saytdan yalnız 29 metastabil epialel tapdıq.”

“Başqa bir təəccüblü tapıntı, ana pəhrizinin, xüsusən də folat və B12 vitamini kimi pro-metilasiya qidaları ilə əlavələrin yeni kəşf edilmiş metastabil epialellərin metilasiyasına heç bir təsir göstərməməsi idi” dedi layihənin birinci müəllifi Udita Maduranqa.

^{“Bu, A vy} kimi siçan metastabil epialellərinin klassik tədqiqatlarından fərqlənir ki , bu da ananın metil donor əlavəsinin onların metilasiyasını artırdığını göstərdi.”

^{“20 il əvvəl A vy} siçanlarında pəhriz əlavəsi effektinin kəşfi bizi insanlarda metastabil epialelləri axtarmağa sövq etdi” dedi Waterland.

Bu səylər, sistemli fərdlərarası epigenetik variasiyanın əlaqəli bölgələri üçün CoRSIV adlı minlərlə insan genomik bölgəsinin kəşfinə səbəb oldu. Bunların əksəriyyəti genetik variasiyadan təsirlənir, buna görə də metastabil epialel deyillər.

^{“İronik olaraq,” deyə Vaterlend davam etdi, “insan CoRSIV-lərində DNT metilasiyasının qurulması, A vy} metastabil epialleldə olduğu kimi, erkən embrionun mühitinə çox həssasdır . Bundan əlavə, CoRSIV-lər insan xəstəliklərində güclü şəkildə iştirak edir.” 10.000 insan CoRSIV (inbred siçanlarda yalnız 29 metastabil epialele qarşı) göstərir ki, əksər sistemli fərdlərarası epigenetik variasiya genetik variasiya ilə bağlıdır.

“Onilliklər boyu biotibbi tədqiqatlarda istifadə edilən doğma siçanların əvəzinə ,” Waterland davam edir, “nəticələrimiz göstərir ki, inkişaf zamanı qidalanmanın insanlarda fərdlərarası epigenetik variasiyaya necə təsir etdiyini anlamaq üçün daha yaxşı model ola bilər.”

Daha çox məlumat: Chathura J Gunasekara et al, Siçan metastabil epialelləri olduqca nadirdir, Nuklein Turşuları Araşdırması (2025). DOI: 10.1093/nar/gkaf624

Jurnal məlumatı: Nuklein turşularının tədqiqatı 

Baylor Tibb Kolleci tərəfindən təmin edilmişdir