Schleswig-Holstein Universiteti Tibb Mərkəzində (UKSH), Kiel Kampusunda, Kiel Universitetindən və Maks Plank Molekulyar Genetika İnstitutunda (Berlin) tədqiqatçılar qrupu əməliyyat zamanı beyin şişlərinin real vaxt rejimində molekulyar genetik təsnifatı üçün innovativ metod işləyib hazırlayıblar. Bu yanaşma əməliyyat zamanı şiş növü haqqında ətraflı məlumat vermək üçün DNT metilasiya analizini qabaqcıl maşın öyrənmə texnologiyaları ilə birləşdirir.

İlk dəfə olaraq, neyrocərrahiyyə təkcə şişin yeri və kritik beyin funksiyalarına yaxınlığına deyil, həm də onun spesifik molekulyar xüsusiyyətlərinə uyğunlaşdırıla bilər. Bu , xüsusilə mürəkkəb hallarda xəstələr üçün həlledici üstünlük olan şişin çıxarılmasına məqsədyönlü yanaşma imkanı verir . Tapıntılar 28 fevral 2025 – ci ildə Nature Medicine jurnalında dərc edilib .

“Yalnız fundamental tədqiqat alimləri və tərcümə tibbində çalışan həkimlər arasında sıx əməkdaşlıq sayəsində dəqiqlik və sürət baxımından bütün əvvəlki oxşar yanaşmaları üstələyən bir metod inkişaf etdirmək mümkün oldu” dedi. Prof.

O, MPIMG-də keçmiş “Hesablama genomikası” qrupunun rəhbəri Prof. Dr. Helene Kretzmer, MPIMG-də keçmiş postdok, Ph.D Dr. Alena van Bömmel ilə birlikdə fənlərarası komandaya rəhbərlik etmişdir. tələbə Mara Steiger, MPIMG və Ph.D. tələbə Björn Brändl, İnteqrativ Psixiatriya Mərkəzi, Kampus Kiel.

Tədqiqat UKSH, Campus Kiel-in Neyrocərrahiyyə Departamenti ilə əməkdaşlıqda aparılıb. “Neyrocərrahiyyədə keçmiş irəliləyişlər şişin çıxarılması üçün incə üsullara malik olsa da, xəstəlik mərkəzli bu yanaşma bütün prosedurda inqilab edir. Sadəcə olaraq şişin yerləşdiyi yerə diqqət yetirmək əvəzinə, şiş növünün intraoperativ identifikasiyası şişin biologiyasına əsaslanan cərrahi strategiyada real vaxt rejimində düzəlişlər etmək üçün yeni imkanlar açır.

Neyrocərrahiyyə Klinikasının baş həkimi Dr. Karolin Kubelt-Kvamin deyir: “Bu yanaşma dəqiq tibb ilə neyrocərrahiyyəni birbaşa əlaqələndirir, müalicəni texnikaya əsaslanan prosedurdan fərdiləşdirilmiş, xəstəliyə əsaslanan terapiyaya yüksəldir.

Epigenetik marker olan DNT metilasiyası şişin mənşəyini əks etdirən “barmaq izi” kimi xidmət edir. Müxtəlif növ şişlər, ardıcıllıqla təhlil edilə bilən fərqli metilasiya nümunələri nümayiş etdirir. Yeni üsul bu nümunələri diqqətəlayiq sürət və dəqiqliklə müəyyən etmək üçün nanopore ardıcıllığından istifadə edir.

“Lakin, bu ardıcıllıq cərrahiyyənin dar müddətində baş verməli olduğu üçün, o, real olaraq şişin metilasiya nümunələrinin yalnız bir hissəsini tuta bilər” deyə Dr. Kretzmer izah edir. Bu məhdudiyyəti aradan qaldırmaq üçün tədqiqatçılar Bayes teoremi kimi tanınan ehtimal nəzəriyyəsindən riyazi yanaşma tətbiq etdilər.

Mara Steiger deyir: “Bu metoddan istifadə etməklə, biz xüsusi proqram təminatı ilə birlikdə ardıcıllıq məlumatlarını real vaxt rejimində emal edən və genetik məlumatların 0,1%-dən azını istifadə edərək şişlərin təsnifatını bir saatdan az müddətdə həyata keçirən maşın öyrənmə modelini öyrətdik”. Bu, saatlarla həftələr çəkən əvvəlki üsullarla müqayisədə əhəmiyyətli irəliləyişdir.

Tədqiqat göstərir ki, bu yeni metodun nəticələri tam nevropatoloji müayinənin nəticələri ilə üst-üstə düşür. Tədqiqatçılar vurğulayırlar ki, metod hətta diaqnostik cəhətdən çətin olan şişləri də dəqiq təsnif edə bilir, burada ənənəvi histopatoloji üsullar çox vaxt uğursuz olur. Bu yenilik, xüsusilə mürəkkəb hallarda, şişin çıxarılmasına daha məqsədyönlü və dəqiq yanaşmanı təmin etməklə xəstələr üçün əhəmiyyətli üstünlüklər təklif edir.

Müasir molekulyar və epigenetik analizlər əvvəllər xərçəngin bir növü olduğu düşünülən bir çox şişin əslində çox müxtəlif olduğunu ortaya qoydu. Məsələn, mərkəzi sinir sisteminin şişləri indi 90-a yaxın fərqli kateqoriyaya bölünür. Bu fərqlər fərqli terapevtik strategiyalar tələb edir. Bəzi şişlər radiasiya və ya dərman vasitəsi ilə müalicə oluna bilsə də, digərləri geniş cərrahi müdaxilə tələb edir.

Ancaq indiyə qədər şiş toxuması yalnız əməliyyatdan sonra təhlil edilirdi, bu da cərrahları əməliyyat zamanı şişin təsnifatı ilə bağlı qeyri-müəyyən qoyur və onları sağlam beyin toxumasına zərər verə biləcək qərarlar qəbul etməyə məcbur edirdi. İntraoperativ DNT metilasiya analizi nanopor sekvensiyası ilə birlikdə indi cərrahların daha məlumatlı qərarlar qəbul etmək üçün real vaxt rejimində istifadə edə biləcəyi kritik məlumatları təmin edir və fərdiləşdirilmiş dəqiq cərrahiyyəni dəstəkləyir.

Daha çox məlumat: Björn Brändl et al, Seyrək epigenomik məlumatlardan sürətli beyin şişinin təsnifatı, Təbiət Təbabəti (2025). DOI: 10.1038/s41591-024-03435-3

Jurnal məlumatı: Nature Medicine Max Planck Cəmiyyəti tərəfindən təmin edilmişdir