Katharina Kalhoff, Berlin Sağlamlıq İnstitutu der Charité

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Ovrlpy, görüntüləmə əsaslı SRT məlumatlarında şaquli olaraq üst-üstə düşən hüceyrələri müəyyən edir. Mənbə: Nature Biotechnology (2026). DOI: 10.1038/s41587-026-03004-8. https://www.nature.com/articles/s41587-026-03004-8

Yeni proqram təminatı olan ovrlpy, biotibbi tədqiqatlarda əsas texnologiya olan məkan transkriptomikasında keyfiyyətə nəzarəti təkmilləşdirir. Berlin Charité Səhiyyə İnstitutu (BIH) tərəfindən beynəlxalq əməkdaşlıq çərçivəsində hazırlanmış ovrlpy, toxuma hissələrində hüceyrə üst-üstə düşmələrini və qatlanmalarını müəyyən edən və bununla da əvvəllər tanınmamış səhv şərh mənbələrini azaldan ilk vasitədir. Tədqiqatçılar nəticələrini Nature Biotechnology jurnalında dərc ediblər .

Məkan transkriptomikası biotibbdə RNT transkriptlərini xəritələşdirməklə və bu molekulyar aktivliyi fərdi hüceyrələrə təyin etməklə toxuma daxilində hüceyrə fəaliyyətini vizuallaşdıran qabaqcıl bir tədqiqat sahəsidir. İndiyə qədər toxuma nümunələrinin bu cür təhlilləri əsasən iki ölçüdə şərh edilmişdir. Bununla belə, hətta insan saçının təxminən onda biri qədər qalınlığında, 5-10 mikrometr qalınlığında olan çox nazik toxuma hissələri belə mürəkkəb üçölçülü bir quruluşa malikdir.

Əgər bu 3D düzülüş yalnız düz bir səth kimi şərh olunarsa, məsələn, hüceyrə üst-üstə düşməsi və ya toxuma qatlanması səbəbindən analitik səhvlər baş verə bilər. Bu, transkriptlərin fərdi hüceyrələrə dəqiq təyin edilməsinə mane olur və sonrakı təhlil və şərhi təhrif edə bilər.

Toxumalarda gizli üst-üstə düşmələrin aşkarlanması

Ovrlpy transkriptlərin üç ölçüdə məkan paylanmasını təhlil edir və hüceyrə üst-üstə düşən və ya təsadüfi toxuma qatlanan sahələrdə siqnal uyğunsuzluqlarını aşkar edir və beləliklə, şaquli ölçüdə indiyə qədər əsasən diqqətdən kənarda qalan potensial səhv mənbələrini aşkar edir. Müxtəlif toxumaların və orqanların hərtərəfli təhlilləri bu cür üst-üstə düşmələrin əvvəllər düşünüləndən daha tez-tez baş verdiyini göstərdi. Bu artefaktları xüsusi olaraq müəyyən etməklə, ovrlpy sonrakı bioinformatik təhlillərin dəqiqliyinin artırılmasına əhəmiyyətli töhfə verir.

“Ovrlpy, səhv nəticələrə gətirib çıxarmazdan əvvəl bu səhv mənbələrini müəyyən etməyə kömək edir”, – deyə BIH-də Roland Eilsin Rəqəmsal Səhiyyə şöbəsində Hesablama Onkologiyası üzrə qrup rəhbəri və tədqiqatın son müəllifi Dr. Naveed Ishaque bildirib. O, əlavə edir ki, “Bu, xərçəng tədqiqatları, nevrologiya və ya fərdiləşdirilmiş terapiyaların inkişafı kimi geniş sahələrdə daha möhkəm anlayışlar üçün zəmin yaradır”.

Məkanla həll edilmiş transkriptomika ( Təbiətin 2020-ci ilin metodu) və ya məkan proteomikası ( Təbiətin 2024-cü ilin metodu) kimi məkan texnologiyalarının adi biotibbi tədqiqatlarda getdikcə daha çox istifadəsi ilə yüksək keyfiyyətli məlumatların təmin edilməsi getdikcə daha vacib hala gəlir. Ovrlpy buna əhəmiyyətli töhfə verir və toxumaların mürəkkəb arxitekturası və funksiyasının etibarlı təhlillərinə imkan verir.

Nəşr detalları

Sebastian Tiesmeyer və digərləri, Ovrlpy ilə fəza transkriptomikası məlumatlarında 3D siqnal üst-üstə düşmələrinin müəyyən edilməsi, Nature Biotechnology (2026). DOI: 10.1038/s41587-026-03004-8 . www.nature.com/articles/s41587-026-03004-8

Jurnal məlumatları: Təbiət Biotexnologiyası , Təbiət  

Əsas anlayışlar

aeroradiometrik tədqiqatbioloji informatikaBioinformatika

Berlin Charité Səhiyyə İnstitutu tərəfindən təmin edilir