Gen tənzimlənməsi demək olar ki, hər bir bioloji prosesin əsasını təşkil edir – hüceyrə inkişafından ətraf mühitdəki dəyişikliklərə reaksiyalara qədər və onun başa düşülməsi xərçəng və digər xəstəliklər haqqında məlumat verə bilər. İndi FMI tədqiqatçıları gen tənzimləməsini öyrənmək üçün əsas model orqanizm olan parçalanma mayasında transkripsiya faktorlarının – gen ifadəsini idarə edən zülalların necə işlədiyini aşkar etməkdə əhəmiyyətli irəliləyiş əldə etdilər.

Komandanın araşdırması Molecular Cell jurnalında dərc olunub .

Gen tənzimlənməsində əsas oyunçulardan biri transkripsiya faktorlarıdır – DNT-nin xüsusi bölgələrinə bağlanaraq genlərin ifadəsini idarə edən zülallar. Bu zülallar müxtəlif siqnallara cavab olaraq genlərin ifadə səviyyəsini tənzimləyən açar rolunu oynayır.

Alimlər parçalanma mayası (Schizosaccharomyces pombe) kimi sadə orqanizmləri öyrənərək genlərin necə idarə olunduğu haqqında çox şey öyrəniblər . Bununla belə, transkripsiya faktorlarının əksəriyyəti tam öyrənilməmişdir və gen aktivliyini tənzimləmək üçün bu zülalların DNT və digər zülallarla necə işləməsi haqqında hələ çox şey öyrənilməlidir.

Transkripsiya faktorlarının gen ifadəsini necə idarə etdiyini araşdırmaq üçün Ph.D Merle Skribbenin rəhbərlik etdiyi tədqiqatçılar. Bühler laboratoriyasının tələbəsi, 89 fərqli parçalanma maya ştammını yaratmaq üçün genom redaktəsindən istifadə etdilər. Hər bir ştammda onlar bu zülalları fərdi şəkildə öyrənməyi və onların digər zülallar və DNT ilə qarşılıqlı təsirini xəritələşdirməyi asanlaşdıran markerlə xüsusi transkripsiya faktorunu qeyd etdilər.

Tədqiqatçılar DNT-nin bir çox fərqli transkripsiya faktoru ilə bağlanmış “İSTİ” bölgələrini müəyyən etdilər və yeni qarşılıqlı təsirlər kəşf etdilər. Bunlara müəyyən tənzimləyici zülallarla qarşılıqlı təsirlər daxildir ki, bu da transkripsiya faktorunun fəaliyyətinə nəzarət etmək üçün orqanizmlər arasında ortaq bir metod ola biləcəyini göstərir. Skribbe deyir ki, tapıntılar parçalanma mayasında genlərin necə tənzimləndiyinə dair anlayışımızı inkişaf etdirir, eyni zamanda digər orqanizmlərdə genlərin tənzimlənməsi ilə bağlı fikirləri də ortaya qoya bilər.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=188&slotname=8188791252&adk=1687169288&adf=4203178812&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&abgtt=6&fwrn=4&lmt=1740636105&rafmt=11&format=750×188&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-02-gene-secrets-fission-yeast-strains.html&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTMzLjAuNjk0My4xNDEiLG51bGwsMCxudWxsLCI2NCIsW1siTm90KEE6QnJhbmQiLCI5OS4wLjAuMCJdLFsiR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzMy4wLjY5NDMuMTQxIl0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzMy4wLjY5NDMuMTQxIl1dLDBd&dt=1740636105462&bpp=1&bdt=68&idt=23&shv=r20250225&mjsv=m202502200101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1740636012%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1740636012%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3Dcdf7f2f01784f52d%3AT%3D1735196613%3ART%3D1740636012%3AS%3DAA-Afjb8kbeupLLyQ0QHQmZxpM4v&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=386021174165&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=3&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=447&ady=2606&biw=1903&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31090663%2C31090665%2C31090357%2C95350015%2C95353782&oid=2&pvsid=2963660383634291&tmod=1306343419&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fpage2.html&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=29

Əsas tapıntı tədqiqatçıların “Nattou kompleksi” adlandırdıqları bir cüt transkripsiya faktorunun kəşfi oldu. Bu kompleks gen ifadəsini tənzimləyir və müəyyən genlərin nüvədə yerləşməsinə təsir göstərir – inkişafı, immun cavabları və digər mühüm bioloji prosesləri tənzimləmək üçün vacib olan gen susdurma mexanizmlərinin daha yaxşı başa düşülməsini təmin edə biləcək bir tapıntı.

İş həmçinin FMI TFexplorer-in yaradılmasına gətirib çıxardı ki, bu da elm adamlarına transkripsiya faktoru ilə qarşılıqlı əlaqəni asan və interaktiv şəkildə araşdırmaq imkanı verir – heç bir qabaqcıl kompüter bacarıqları tələb olunmur.

Bühler öz qrupu ilə MBİ-dəki texnologiya platformaları arasında komanda işinin vacibliyini vurğulayır. Funksional Genomika və Proteomika və Zülal Analizi platformalarından olan tədqiqatçılar məlumatların toplanmasına kömək etdi və Skribbe onu təhlil etmək üçün Hesablama Biologiya platformasından Charlotte Soneson və Michael Stadler ilə işlədi.

Bühler həmçinin Skribbenin rəhbərliyini yüksək qiymətləndirərək onun qeyri-adi müstəqilliyini və liderliyini qeyd edib. “Bunun üçün mən ona kağız üzərində həmmüəlliflik təklif etdim – onun karyera mərhələsində nadir bir fərq” dedi.

Bühler əlavə edir ki, tədqiqat transkripsiya faktorlarının rolunu anlamaqda irəliyə doğru mühüm addımdır və gen tənzimlənməsinin mürəkkəbliklərini araşdıran elm adamları üçün güclü resurs təklif edən açıq giriş məlumatları ilə.

Ətraflı məlumat: Merle Skribbe və digərləri, Zülallar və xromatin ilə fiziki transkripsiya faktorunun qarşılıqlı təsirinin hərtərəfli Schizosakcharomyces pombe atlası, Molecular Cell (2025). DOI: 10.1016/j.molcel.2025.01.032

Jurnal məlumatı: Molecular Cell 

Friedrich Miescher Biotibbi Tədqiqatlar İnstitutu tərəfindən təmin edilmişdir