RAEFISH texnikası mürəkkəb toxumada RNT fəaliyyətinə daha böyük və daha yaxşı pəncərə təqdim edir

Karen Guzman, Yale Universiteti
Gaby Clark tərəfindən redaktə edilmiş , Robert Eqan tərəfindən nəzərdən keçirilmişdir
Redaktorların qeydləriQrafik abstrakt. Kredit: Cell (2025). DOI: 10.1016/j.cell.2025.09.006
Yale tədqiqat qrupu tərəfindən yaradılan yeni texnologiya sayəsində elm adamları ilk dəfə olaraq RNT molekullarını birbaşa hüceyrələr və toxumalar daxilində və eyni zamanda bütün insan genomunda ətraflı şəkildə görə bilirlər.
Tərs asma kilidli Amplikon Kodlayan Flüoressensiya In Situ Hibridləşmə (RAEFISH) kimi tanınan texnika, tədqiqatçıların uzun müddətdir etmək məcburiyyətində qaldıqları problemi həll edir: təfərrüat və əhatə dairəsi. Əvvəlki alətlər tədqiqatçılardan ya məhdud sayda geni yüksək təfərrüatda görmək, ya da bir çox geni görmək, lakin onların transkriptlərinin (RNT) yeri və onların qarşılıqlı əlaqəsi ilə bağlı məhdud təfərrüat səviyyəsi arasında seçim etməyi tələb edirdi.
Yale Tibb Məktəbinin genetika və hüceyrə biologiyası üzrə dosenti Siyuan (Steven) Wang, “Biz hər iki ehtiyacı eyni anda ödəyən bir texnika hazırladıq” dedi . “Bu, məkan transkriptomikası sahəsində əvvəlki texnologiyaların əsas məhdudiyyətlərini həll edir.”
Yeni texnologiya Cell jurnalında dərc edilən araşdırmada təsvir edilib .
Şəkil əsaslı məkan transkriptomikası üsulları RNT yerini və gen ifadə nümunələrinin xəritəsini çıxarmaq üçün hüceyrələrdə və toxumalarda RNT molekullarını birbaşa təsvir edir.
Tədqiqatçılar deyirlər ki, RAEFISH texnikası bu görüntüləmə prosesində güclü irəliləyişdir. Hüceyrə daxilindəki RNT molekullarına bağlanan xüsusi zondlar dizayn edərək onu yaratdılar. Zondlar hədəflənmiş RNT-lərin surətlərini çıxarır və floresan etiketlər əlavə edilir ki, RNT-lər mikroskop altında görünə bilsin.
https://www.youtube.com/embed/p-hEUte3IKs?color=whiteKredit: Yale Universiteti
İnsan hüceyrələrində və siçanların qaraciyəri, plasenta və limfa düyünlərinin toxumalarında sınaqdan keçirilmiş üsul 20.000-dən çox gendən fərqli RNT molekullarını müəyyən edə bilir. RAEFISH hüceyrə növlərinin xəritəsini çıxara, hüceyrələrin necə təşkil edildiyini göstərə və gen ifadə nümunələri vasitəsilə müxtəlif hüceyrə növləri arasında qarşılıqlı əlaqəni aşkar edə bildi.
https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=8188791252&adk=1645945215&adf=308666314&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1759482490&rafmt=1&armr=3&plas=164x742_l%7C164x742_r&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-10-raefish-technique-bigger-window-rna.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&aieuf=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTQwLjAuNzMzOS4xMjgiLG51bGwsMCxudWxsLCI2NCIsW1siQ2hyb21pdW0iLCIxNDAuMC43MzM5LjEyOCJdLFsiTm90PUE_QnJhbmQiLCIyNC4wLjAuMCJdLFsiR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjE0MC4wLjczMzkuMTI4Il1dLDBd&abgtt=6&dt=1759482489870&bpp=1&bdt=117&idt=98&shv=r20251001&mjsv=m202509240101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1759481975%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1759481975%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3D1241933dda87baba%3AT%3D1750839581%3ART%3D1759481975%3AS%3DAA-AfjZwPuiSAour3k16ZA1JtXua&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=2884659684503&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=3&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2610&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31094918%2C42532523%2C95370627%2C95372357&oid=2&pvsid=2918608188691012&tmod=1102675490&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=263
Tədqiqatçıların fikrincə, bu, təkcə hansı genlərin aktiv olduğunu deyil, həm də hüceyrə və ya toxumanın harada işlədiyini aşkar etməyə kömək edəcək. Bundan əlavə, genişləndirilmiş baxış mürəkkəb toxumada inkişaf və qocalma prosesləri, nə qədər xəstəliklərin inkişaf və irəliləyişləri haqqında yeni anlayışlar təmin edə bilər.
“Biz potensial olaraq xərçəng kimi xəstəliklərin müalicəsi üçün yeni terapevtik biomarkerlər kəşf edə bilərik, burada xərçəng hüceyrələrinin ətrafdakı toxuma mikromühitindəki digər hüceyrələrlə necə qarşılıqlı əlaqədə olduğunu anlamaq vacibdir ” dedi Wang.
Wang dedi ki, RAEFISH kimi görüntüləmə omics texnologiyasındakı irəliləyişlər bu gün tibbi tədqiqatların gələcəyini idarə edir və yeni terapevtik müdaxilələrə təkan verir.
“Biz alətlərin daha böyük mürəkkəblik səviyyəsinin öhdəsindən gəlmək üçün əlçatan olduğu bir dövrdəyik” dedi. “İndi gen ifadəsini və hüceyrə qarşılıqlı təsirini yerli toxuma mühitinin mürəkkəbliyində daha ətraflı öyrənə bilmək, bir sıra xəstəliklərin araşdırılmasında faydalı olacaq.”
Daha çox məlumat: Yubao Cheng və digərləri, Tək molekullu rezolyusiyada ardıcıllıqsız tam genom məkan transkriptomikası, Cell (2025). DOI: 10.1016/j.cell.2025.09.006
Jurnal məlumatı: Cell
Yale Universiteti tərəfindən təmin edilmişdir