Scripps Research şirkətinin alimləri lupus və Alzheimer xəstəliyi kimi otoimmün və iltihabi şərtlərlə əlaqəli fermentlərin atom səviyyəli struktur modellərini işləyib hazırlayıblar.

DNT və ya RNT kimi nuklein turşuları hüceyrənin sitoplazmasında toplandıqda, immunitet sistemini xəbərdar edir. Normal şəraitdə problemlərin qarşısını almaq üçün fermentlərə bu nuklein turşularını təmizləmək vəzifəsi verilir. Ancaq bu fermentlər düzgün işləməzsə və immunitet sistemi müdaxilə edərsə, bu, otoimmün və iltihablı xəstəliklərlə nəticələnə bilər.

Structure jurnalında bu yaxınlarda dərc edilmiş yeni bir araşdırmada Scripps Research alimləri bu nuklein turşusunu parçalayan fermentlərdən ikisinin – PLD3 və PLD4-ün əvvəllər təsvir olunmamış strukturunu təqdim edirlər. Bu fermentlərin strukturlarını və molekulyar təfərrüatlarını başa düşmək, lupus eritematosus, revmatoid artrit və Alzheimer xəstəliyi daxil olmaqla, onların işləməməsi zamanı yaranan müxtəlif xəstəliklər üçün müalicələrin layihələndirilməsi istiqamətində mühüm addımdır .

Scripps Research-də İmmunologiya və Mikrobiologiya Departamentinin professoru, baş müəllif David Nemazee deyir: “Bu fermentlər hüceyrə mühitini təmizləmək üçün vacibdir və onlar həm də infeksiya hesab edilən və ya olmayan şeylər üçün hədd qoyurlar”. “Ümid edirəm ki, nə vaxtsa bu məlumat əsasında xəstələrə kömək edə biləcəyik.”

Fermentlərin funksionallığı və analiz üsulları

Fermentlər, substrat adlanan xüsusi molekulları bağlayaraq və reaksiya verərək kimyəvi reaksiyaları sürətləndirən zülallardır. PLD3 və PLD4 vəziyyətində, substrat fermentlərin nukleotidi nukleotidlə parçaladığı RNT və ya DNT zənciridir.

Komanda müxtəlif vəziyyətlərdə və ya situasiyalarda PLD3 və PLD4-ün atom miqyaslı modellərini yaratmaq üçün rentgen kristalloqrafiyasından istifadə edərək, onların formalarının katalitik reaksiya zamanı necə dəyişdiyini araşdırmaq imkanı verdi. Bu, fermentlərin istirahət etdiyi və ya substrata aktiv şəkildə bağlandığı zaman daxildir.

“Bu modellər bizə PLD3 və PLD4-ü çox aydın və yüksək dəqiqliklə təsəvvür etməyə imkan verir, buna görə də biz hər bir atomun necə qarşılıqlı əlaqədə olduğunu dəqiq bilirik, yəni fermentlərin necə işlədiyini çıxara bilərik” dedi İnteqrasiya Departamentinin işçi alimi, birinci müəllif Menq Yuan Scripps Tədqiqatında Struktur və Hesablama Biologiyası.