Tədqiqat qrupu yüksək sıxlıqlı RNT mikroarraylarının daha sürətli və daha səmərəli sintezinə nail olur
Vyana Universitetinin rəhbərlik etdiyi beynəlxalq tədqiqat qrupu daha yüksək kimyəvi reaktivliyə və fotohəssaslığa malik RNT tikinti bloklarının yeni versiyasını hazırlamağa müvəffəq olub. Bu, biotexnoloji və tibbi tədqiqatlarda istifadə edilən RNT çiplərinin istehsal müddətini əhəmiyyətli dərəcədə azalda bilər.
Bu çiplərin kimyəvi sintezi indi iki dəfə sürətli və yeddi dəfə daha səmərəlidir. Araşdırmanın nəticələri “Science Advances ” jurnalında dərc olunub .
COVID-19 pandemiyası zamanı mRNA vaksinləri kimi RNT əsaslı tibbi məhsulların ortaya çıxması və təsdiqlənməsi RNT molekulunu ictimaiyyətin diqqətinə çatdırdı.
RNT ( ribonuklein turşusu ) məlumat daşıyan polimerdir – oxşar alt bölmələrdən ibarət kimyəvi birləşmədir, lakin DNT-dən daha çox struktur və funksional müxtəlifliyə malikdir.
Təxminən 40 il əvvəl DNT və RNT-nin kimyəvi sintezi üçün fosforamidit kimyasından istifadə edərək DNT və ya RNT tikinti bloklarından istənilən ardıcıllığın yığıla biləcəyi bir üsul hazırlanmışdır.
Nuklein turşusu zəncirinin yığılması bu xüsusi kimyəvi tikinti bloklarından (fosforamiditlərdən) istifadə etməklə mərhələli şəkildə həyata keçirilir. Hər bir tikinti blokunda arzuolunmaz reaksiyaların qarşısını alan və nuklein turşusu zəncirində təbii halqanın meydana gəlməsini təmin edən kimyəvi “qoruma qrupları” vardır.
Problemlərin aradan qaldırılması
Bu kimyəvi üsul mikroçiplərin (mikroarrayların) istehsalında da istifadə olunur, burada milyonlarla unikal ardıcıllıq eyni vaxtda dırnaq ölçüsündə bərk səthdə sintez oluna və təhlil edilə bilər. DNT mikrodiziləri artıq geniş şəkildə istifadə olunsa da, texnologiyanı RNT mikroarraylarına uyğunlaşdırmaq RNT-nin daha aşağı sabitliyinə görə çətin olmuşdur.
2018-ci ildə Vyana Universiteti fotolitoqrafiya vasitəsilə yüksək sıxlıqlı RNT çiplərinin necə istehsal oluna biləcəyini nümayiş etdirdi: işıq şüasını dəqiq yerləşdirməklə səthdəki sahələr fotokimyəvi reaksiya vasitəsilə növbəti tikinti blokunun yapışdırılması üçün hazırlana bilər.
Baxmayaraq ki, bu ilk hesabat dünyada bir ilkdir və rakipsiz olaraq qalır, metod uzun istehsal müddətləri, aşağı məhsuldarlıq və zəif sabitlikdən əziyyət çəkirdi. Bu yanaşma indi xeyli təkmilləşdirilmişdir.
https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=135&slotname=8188791252&adk=2329133447&adf=1857921027&pi=t.ma~as.8188791252&w=540&abgtt=6&fwrn=4&lmt=1722499972&rafmt=11&format=540×135&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2024-07-team-faster-efficient-synthesis-high.html&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTUuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTI3LjAuNjUzMy43NCIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJOb3QpQTtCcmFuZCIsIjk5LjAuMC4wIl0sWyJHb29nbGUgQ2hyb21lIiwiMTI3LjAuNjUzMy43NCJdLFsiQ2hyb21pdW0iLCIxMjcuMC42NTMzLjc0Il1dLDBd&dt=1722493562212&bpp=2&bdt=656&idt=184&shv=r20240729&mjsv=m202407250101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3D6bf3eefe49031f83%3AT%3D1721367059%3ART%3D1722499720%3AS%3DALNI_MacAfAOJA8VyURIyKJCZKOtEk96_Q&eo_id_str=ID%3D253fe466b124068d%3AT%3D1721367059%3ART%3D1722499720%3AS%3DAA-Afja3CR3UFVWEVuVSmzApOeu3&prev_fmts=0x0%2C1519x694&nras=2&correlator=155214313520&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=1&u_h=864&u_w=1536&u_ah=816&u_aw=1536&u_cd=24&u_sd=1.25&dmc=8&adx=395&ady=2290&biw=1519&bih=695&scr_x=0&scr_y=0&eid=44759876%2C44759927%2C44759837%2C95334527%2C95334830%2C95337026%2C95337870%2C95335245%2C95339233%2C95336266%2C31078663%2C31078665%2C31078668%2C31078670&oid=2&pvsid=3820531965756962&tmod=917552411&uas=0&nvt=3&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1536%2C0%2C0%2C0%2C1536%2C695&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=0&td=1&tdf=0&psd=W251bGwsbnVsbCwibGFiZWxfb25seV8xIiwxXQ..&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=M
Yeni nəsil RNT tikinti bloklarının inkişafı
Vyana Universitetinin Qeyri-üzvi Kimya İnstitutundan bir qrup Montpellier Universitetinin (Fransa) Maks Mousseron Biomolekullar İnstitutu ilə əməkdaşlıq edərək, indi daha yüksək kimyəvi reaktivliyə və fotohəssaslığa malik RNT tikinti bloklarının yeni versiyasını hazırlayıb.
Bu irəliləyiş RNT çiplərinin istehsal müddətini əhəmiyyətli dərəcədə azaldır, sintezi iki dəfə sürətli və yeddi dəfə daha səmərəli edir. Yenilikçi RNT çipləri geniş tətbiqlər üçün dəyərli ardıcıllıqlar üçün milyonlarla namizəd RNT-nin ekranlaşdırılması üçün istifadə edilə bilər.
Qeyri-üzvi Kimya İnstitutunun dosenti Jory Lietard deyir: “Funksional RNT molekullarını ehtiva edən RNT mikromassivlərinin yaradılması bizim əvvəlki quraşdırma ilə sadəcə əlçatmaz idi, lakin propioniloksimetil (PrOM) qoruyucu qrupundan istifadə etməklə bu təkmilləşdirilmiş proses indi reallıqdır” dedi. .
Bu təkmilləşdirilmiş RNT çiplərinin birbaşa tətbiqi kimi nəşrdə RNT aptamerlərinin, xüsusi olaraq hədəf molekula bağlanan kiçik oliqonukleotidlərin tədqiqi yer alır.
Bir boyaya bağlandıqdan sonra flüoresan istehsal edən iki “işıqlanan” aptamer seçilmiş və bu aptamerlərin minlərlə variantı çipdə sintez edilmişdir . Bütün variantlar üzrə eyni vaxtda məlumat əldə etmək üçün tək bir məcburi sınaq kifayətdir ki, bu da daha yaxşı diaqnostik xüsusiyyətlərə malik təkmilləşdirilmiş aptamerlərin müəyyən edilməsinə yol açır.
“Yüksək keyfiyyətli RNT çipləri qeyri-invaziv molekulyar diaqnostikanın sürətlə inkişaf edən sahəsində xüsusilə qiymətli ola bilər. Yeni və təkmilləşdirilmiş RNT aptamerləri, məsələn, real vaxt rejimində hormon səviyyələrini izləyə bilən və ya digər bioloji markerləri birbaşa izləyə bilənlər kimi ciddi şəkildə axtarılır. tərdən və ya tüpürcəkdən”, – deyə Ph.D. Tadija Kekić deyir. Jory Lietard qrupunun namizədi.
Ətraflı məlumat: Tadija Kekić və digərləri, RNT mikroarraylarının in situ sürətləndirilmiş, yüksək keyfiyyətli fotolitoqrafiya sintezi, Elm İnkişafı (2024). DOI: 10.1126/sciadv.ado6762 . www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ado6762
Jurnal məlumatı: Elmin inkişafı