Tədqiqatçılar hələ də insan xərçənglərində gen ifadəsinə təsir edən amillərin hərtərəfli mənzərəsinə malik deyillər. Xərçəngdə gen ifadəsini başa düşmək vacibdir, çünki o, xəstəliyin necə başladığını, inkişaf etdiyini və potensial olaraq necə idarə olunacağını və ya aradan qaldırılacağını göstərə bilər.

Bu sahədə anlayışımızı yaxşılaşdırmaq üçün Baylor Tibb Kollecinin tədqiqatçıları və əməkdaşlıq edən institutlar xərçəngdə ilk dəfə iki genetik variasiya mənbəyi arasında əlaqəni araşdırdılar: DNT ardıcıllığında böyük fərqlərə istinad edən rüşeym xətti və ya irsi struktur variasiya (SV) və DNT kodunun dəyişdirilməsi aktiv və ya söndürüldükdə DNT metilasiyası.

Onlar germline SV-lərin çoxsaylı genlərin ifadəsini dəyişdirən müxtəlif növ beyin şişlərində DNT metilasiyasına təsir etdiyini aşkar etdilər . Komanda təsirlənmiş genlərin kataloqunu yaratdı. Bu gen dəyişikliklərinin bir çoxu xərçəngdə rol oynamasa da, bəziləri xəstəliyə meyllilik və xəstənin sağ qalması da daxil olmaqla xərçənglə əlaqəli rollarda iştirak edir. Tədqiqat Nature Communications jurnalında dərc olunub .

“Alimlər genetik kodun ayrı-ayrı “hərflərində” dəyişikliklər və ya mutasiyaları tədqiq etməklə xərçəngin necə yarandığı və inkişaf etdiyi haqqında çox şey öyrəndilər. Biz genetik kodda cücərmə xətti və ya irsi struktur dəyişikliyi kimi tanınan daha böyük variasiyaların insan xərçənglərində gen ifadəsinə necə təsir etdiyini öyrənərək fərqli bir yanaşma tətbiq etdik “, – deyə xərçəngin müxbir müəllifi və professoru Dr. Baylordakı Dan L Duncan Kompleks Xərçəng Mərkəzində bioinformatika.

“Struktur variasiya çatışmayan, təkrarlanan və ya dəyişdirilmiş DNT bölmələrini əhatə edən fərdlər arasında DNT ardıcıllığında böyük fərqlərə aiddir. Bu daha böyük variasiyalar genlərin necə işə salınmasına və ya söndürülməsinə təsir göstərə bilər, xüsusən də genomun mühüm nəzarət bölgələrinin yaxınlığında baş verdikdə.”

DNT metilasiyası hüceyrələrin fərdlər arasında normal genetik dəyişkənliyi tənzimləməsinin başqa bir yoludur. Bu zaman hüceyrələr genetik kodu dəyişmədən öz gen fəaliyyətini tənzimləyirlər. Epigenetika kimi tanınan mexanizm DNT-yə metil qrupları kimi kimyəvi etiketlər əlavə etməklə işləyir. Teqlər bir geni işə sala və ya söndürə bilən açar kimi fəaliyyət göstərir. Əvvəlki tədqiqatlar göstərdi ki, həm SV-lər, həm də DNT metilasiya dəyişiklikləri xərçənglə əlaqələndirilir.

“Uşaqların Beyin Şişləri Şəbəkəsi (CBTN) tərəfindən təmin edildiyi kimi, beyin şişi olan uşaqlardan alınan 1292 nümunədə germline SV-lərini və şiş DNT metilasiyasını təhlil etdik” dedi Creighton. “Biz minlərlə SV-nin şişlərdə müxtəlif səviyyələrdə DNT metilasiyası ilə əlaqəli olduğunu aşkar etdik. Bəzi fərqlər digər genlərin ifadəsini tənzimləyən gen gücləndiricilərinə təsir etdi.

“Bir çox hallarda, bu genetik variantlar MSH2, RSPA və PALB2 kimi xərçəngə meylli olduğu bilinən genlərin yaxınlığında baş verir. SV və metilasiya dəyişiklikləri olan digər genlər, POLD4 geni də daxil olmaqla, xəstələrin sağ qalması ilə əlaqəli idi.”

Tədqiqatçılar ümid edirlər ki, onların tapıntıları xərçəngdə genetik və epigenetik təsirlərin mənzərəsini daha yaxşı başa düşmək üçün gələcək tədqiqatları istiqamətləndirəcək və nəticədə risk altında olan uşaqları müəyyən etmək və ya fərdi genetik profillərə uyğun müalicələr hazırlamaq üçün təkmilləşdirilmiş alətlərə gətirib çıxaracaq.

Daha çox məlumat: Fengju Chen və digərləri, uşaq beyin şişlərində cücərmə xəttinin struktur dəyişikliyini əhatə edən qlobal DNT metilasiyası fərqləri, uşaq beyin şişlərində gen ifadəsinə təsir göstərir, Nature Communications (2025). DOI: 10.1038/s41467-025-60110-y

Jurnal məlumatı: Nature Communications Baylor Tibb Kolleci tərəfindən təmin edilmişdir