Sent Jude Uşaq Araşdırma Xəstəxanası, Milli Genomik Analiz Mərkəzi və Adelaide Universitetinin alimləri digər üsullardan 47 dəfə daha ucuz və miqyaslana bilən tək hüceyrəli RNT analizi metodu yaradıblar.

Tək hüceyrəli RNT ardıcıllığı elm adamlarına sağlamlıq və xəstəlikdə gen ifadəsi haqqında vacib məlumatlar verir . Bununla belə, texnika bahalıdır və çox vaxt çox sayda hüceyrənin təhlilini qadağan edir.

Sent Jude Uşaq Araşdırma Xəstəxanası, Milli Genomik Təhlil Mərkəzi və Adelaide Universitetinin alimləri bu məhdudiyyətləri aradan qaldırmaq üçün mikroskopiyanı təkhüceyrəli RNT analizi ilə birləşdirən üsul yaradıblar. Tək Hüceyrəli Transkriptomik Analiz və Görüntüləmə vasitəsilə Multimodal Profilləşdirmə (STAMP) adlı texnika mövcud yanaşmaların dəyərinin bir hissəsi üçün milyonlarla tək hüceyrəyə baxa bilər.

Əsər Cell -də nəşr olunur .

“Biz tək hüceyrəli analizin rəqəmlər oyununda bizə üstünlük verən bir texnika yaratdıq” dedi həmmüəllif Jasmine Plummer, Ph.D., St. Jude Spatial Omics Mərkəzinin direktoru və İnkişaf Neyrobiologiyası Departamentinin üzvü. “Bu, daha sərfəli miqyaslı bir sifarişdir və indiki üsullara xas olan on minlərlə hüceyrə ilə müqayisədə eyni vaxtda bir milyon hüceyrənin profilini yaratmağa imkan verir ki, bu da onu daha miqyaslı edir.”

Tədqiqatçılar fərdi, əlaqəsiz hüceyrələr olana qədər hüceyrələri toxumalardan ayırdılar. Daha sonra onlar həmin hüceyrələri mikroskop slaydlarına fiksasiya etdilər və ya “möhürlədilər”, bu da hüceyrələri öldürür, lakin formaları və ifadə edilmiş genləri də daxil olmaqla, onları vaxtında “bağlayır”. Elm adamları daha sonra xüsusi RNT ardıcıllığına bağlandıqda mikroskop altında işıqlanan molekulları əlavə etdilər.

Tədqiqatçılar nəticələrini çap olunmuş gen ifadəsi məlumatlarının atlasları ilə müqayisə edərək, onların eyni vaxtda bir çox immun hüceyrələrini xarakterizə edə biləcəyini və induksiya edilmiş pluripotent kök hüceyrələrin inkişaf mərhələləri arasında ayrı-seçkilik apara biləcəyini tapdılar . Onlar hesabladılar ki, 1000 nəfərin immun hüceyrələrinin təhlili normal olaraq 3,56 milyon dollara başa gələcək, eyni analizi etmək üçün STAMP-ı genişləndirmək isə 47 dəfə azalma ilə 75,000 dollara başa gələcək.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=8188791252&adk=1645945215&adf=308666314&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1749719546&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-06-imaging-based-technique-democratizes-cell.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM3LjAuNzE1MS4xMDMiLG51bGwsMCxudWxsLCI2NCIsW1siR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTAzIl0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzNy4wLjcxNTEuMTAzIl0sWyJOb3QvQSlCcmFuZCIsIjI0LjAuMC4wIl1dLDBd&dt=1749719546021&bpp=1&bdt=188&idt=55&shv=r20250610&mjsv=m202506090101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1749719256%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1749719256%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3Dcdf7f2f01784f52d%3AT%3D1735196613%3ART%3D1749719256%3AS%3DAA-Afjb8kbeupLLyQ0QHQmZxpM4v&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=2544838812397&rume=1&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=3&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2235&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31092914%2C31092920%2C95353386%2C95362436%2C95362656%2C95344788%2C95362798%2C95359266%2C95362804%2C95363073%2C31092548%2C31061691%2C31061693&oid=2&pvsid=5419879250160807&tmod=1158146187&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=185

Həssaslığı qoruyarkən tək hüceyrəli analizdə qərəzliyi aradan qaldırmaq

Plummer, “Tək hüceyrəli RNT ardıcıllığı üçün mövcud üsullar hüceyrə növü kimi şeyləri müəyyən etmək üçün nəticə tələb edir, lakin STAMP bizə hüceyrələri birbaşa yoxlamağa imkan verir” dedi. “Mövcud bir hüceyrəli yanaşmaların bir çoxu, həmçinin neyronlar da daxil olmaqla, qeyri-düzgün formalı hüceyrələrdən məhrum olan hüceyrə formasına əsaslanan nəticələrə meyl göstərir.”

Adi RNT ardıcıllığı üsulları analiz edilməzdən əvvəl hüceyrələrin bir borudan keçməsini tələb edir. Forma nə qədər sferik və daha sadədirsə, hüceyrə bu maşınlar arasında bir o qədər yaxşı hərəkət edir və nəticədə bəzi qərəzlərə səbəb olur. STAMP texnikası mikroskop slaydında həyata keçirilir, bu problemdən qaçır və daha müxtəlif hüceyrə növlərini təmsil etməyə imkan verir.

Həssaslığın da qorunub saxlanmasını təmin etmək üçün tədqiqatçılar xərçəng hüceyrələrini bir çox digər hüceyrələrin süspansiyonuna seyreltdilər. STAMP bir slaydda təxminən 850.000 ümumi hüceyrə içərisində iki xərçəng hüceyrəsi aşkar etdi.

“Bir milyon hüceyrənin profilini çıxara bilmək çox vacibdir, çünki xərçəng müalicəsindən qaçmaq üçün yalnız bir hüceyrə lazımdır” dedi Plummer. “Biz göstərdik ki, STAMP bizə bu hüceyrələri rəqəmsal cəhətdən sərfəli və əlçatan bir şəkildə vizuallaşdırmağa və aşkar etməyə imkan verir ki, bu da gələcəkdə klinik tətbiqlərə potensial inkişaf üçün vacib bir xüsusiyyətdir.”

Təkhüceyrəli RNT ardıcıllığı, xüsusilə də adətən tələb etdiyi maliyyə, xüsusi avadanlıq və ya hesablama infrastrukturuna çıxışı olmayanlar üçün olduqca bahalı olaraq qalır. Bununla belə, demək olar ki, bütün tədqiqat müəssisələri mikroskoplara asanlıqla daxil olurlar.

“Biz elm adamları olaraq gördüklərimizə inanırıq” dedi Plummer. “STAMP bizə təkhüceyrəli analizdə hər iki dünyanın ən yaxşısını verir: kəmiyyət gen ifadə məlumatları və hüceyrələri mikroskop altında vizual olaraq yoxlamaq imkanı. Ümid edirik ki, bu xüsusiyyətlər onların əlçatanlığı və qənaətcilliyi ilə birlikdə başqalarına gələcəkdə yeni biologiya və klinik istifadələr kəşf etməyə imkan verir.”

Daha çox məlumat: Emanuele Pitino et al, STAMP: Tək Hüceyrəli Transkriptomik Analiz və Görüntüləmə vasitəsilə Multimodal Profilləşdirmə, Hüceyrə (2025). DOI: 10.1016/j.cell.2025.05.027 . www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00577-X

Jurnal məlumatı: Cell 

St. Jude Uşaq Araşdırma Xəstəxanası tərəfindən təmin edilmişdir