Miçiqan Universiteti tərəfindən

Sadie Harley tərəfindən redaktə edilib , Robert Egan tərəfindən nəzərdən keçirilib

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

100-dən çox zülalın monitorinqini həyata keçirən Seq-Scope-X proteom məlumatlarını təmsil edən rəngli nöqtələr. Müəllif: Jun Hee Lee Laboratoriyası

2021-ci ildə Miçiqan Universitetində hazırlanmış Seq-Scope adlı texnologiya, mikroskopik qətnamə ilə bütöv toxuma daxilində gen aktivliyini xəritələşdirmək qabiliyyətini inqilab etdi və tədqiqatçılara Illumina sekvenser maşınından istifadə edərək bütün ifadə olunmuş mRNT molekullarını ölçməyə və toxuma daxilində harada yerləşdiklərini dəqiq müəyyən etməyə imkan verdi. Seq-Scope metodunun arxasındakı komanda, fəlsəfə doktoru Jun Hee Linin rəhbərlik etdiyi komanda, texnologiyanı daha da irəli apardı .

Onların tapıntıları Nature Communications jurnalında təsvir olunub . UM Tibb Məktəbinin Molekulyar və İnteqrativ Fiziologiya professoru Li bildirib ki, “Daha yaxşı qətnaməmiz olsaydı, nə görə biləcəyimizi düşünürdük”.

“Amma başa düşdük ki, bu, əslində fiziki cəhətdən mümkün deyil.”

Illumina sekvenseri tərəfindən oxunmaq üçün toxuma slaydının hazırlanması, molekulların toxumadan massivə diffuziyasını əhatə edir və nəticədə sekvenser tərəfindən oxunur. Bu diffuziya təxminən bir mikronla məhdudlaşır.

Bu maneəni aşmaq üçün Linin komandası toxumaları hidrojelə yerləşdirərək və sonra böyümələri üçün su ilə dolduraraq, sözügedən toxumaları mütənasib olaraq daha böyük hala gətirdi.

Genişləndirmə strategiyası ilk dəfə Linin aspirantı Angelo Anakleto tərəfindən düşünülmüşdür. O, İllinoys Urbana-Şampeyn Universitetinin kimya professoru, fəlsəfə doktoru Hee-Sun Han ilə əməkdaşlıqda kimyəvi toxuma genişləndirmə metodlarını Seq-Scope-a daxil etmişdir.

“Biz toxumanı daha böyük etdik və sonra SeqScope metodologiyamızdan istifadə edərək təhlil etdik”, – deyə Li izah etdi.

“Və biz onun toxumadan transkriptomu həqiqətən dəqiq və dəqiq şəkildə tutduğunu göstərə bildik.”

Özlərinin uyğun adlandırdıqları Seq-Scope-eExpanded və ya Seq-Scope-X metodundan istifadə edərək, hüceyrələr arasındakı sərhədləri və hətta nüvə və sitoplazma kimi hüceyrələr daxilindəki müxtəlif strukturların transkriptlərini daha da dəqiqliklə görməyə imkan verdi.

UM İctimai Səhiyyə Məktəbinin Biostatistika üzrə professoru, fəlsəfə doktoru Hyun Min Kanq tərəfindən hazırlanmış hesablama metodları, komandaya qaraciyər hüceyrələrində nüvədə transkripsiya olunmuş mRNT-lərlə sitoplazma arasındakı fərqləri müəyyən etməyə imkan verdi.

Li deyir ki, bu alətdən əvvəlki metodlarla mümkün olmayan kəşflər etmək üçün istifadə etmək olar.

“Daha zəngin məlumat əldə edə bilmək üçün bu limiti bir qədər artırdıq. Bu texnologiya həqiqətən sürətlə inkişaf edir və təxminən on ildir ki, qətnamə hər il təxminən dörd dəfə artır. Miçiqan Universitetinin böyük bir dönüş nöqtəsində olmasına şadıq.”

Nəşr detalları

Angelo Anacleto və digərləri, Seq-Scope-eGenişləndirilmiş: optik qətnamədən kənar fəza omikası, Nature Communications (2026). DOI: 10.1038/s41467-026-69346-8

Jurnal məlumatları: Nature Communications 

Əsas anlayışlar

Hüceyrə quruluşu, fiziologiyası və dinamikasıNümunə hazırlanması

Miçiqan Universiteti tərəfindən təmin edilir