Melissa Rohman, Şimal-Qərb Universiteti

Lisa Lock tərəfindən redaktə edilib , Robert Egan tərəfindən nəzərdən keçirilib

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Prostat xərçəngi hüceyrələri. Kredit: NIH Şəkil Qalereyası

Nature Communications jurnalında dərc olunan bu yaxınlarda aparılan bir araşdırmaya görə, Şimal-Qərb Tibb alimləri müəyyən bir uzun kodlaşdırmayan RNT-nin prostat xərçəngi hüceyrələrində onkogen siqnal yollarını aktivləşdirdiyini və şişin irəliləməsinə səbəb olduğunu aşkar edərək, onun terapevtik hədəf kimi potensialını vurğulayırlar. Tədqiqatın həmmüəllifi, Urologiya üzrə dosent və Şimal-Qərb Universitetinin Robert H. Lurie Kompleks Xərçəng Mərkəzinin üzvü, fəlsəfə doktoru Rendong Yanq olub.

Uzun kodlaşdırmayan RNT-lər (lncRNA-lar) 200-dən çox nukleotid ehtiva edən və gen ifadəsinin tənzimlənməsində, xüsusən də xərçəngin inkişafında mərkəzi rol oynayan transkriptlərə malik bir RNT növüdür. Əvvəlki işlər xərçənglə əlaqəli bir çox lncRNA-nı müəyyən etsə də, lncRNA-ların hüceyrə tipinə və toxumaya xas gen ifadəsi modellərinə görə lncRNA-ların xərçəngin inkişafına təsir mexanizmləri naməlum olaraq qalmışdır.

Hazırkı tədqiqatda alimlər metastatik kastrasiyaya davamlı prostat xərçəngi olan xəstələrdən alınan RNT ardıcıllıq məlumatlarını öyrənməklə yüksək səviyyəli transkripsiyanı idarə edən tənzimləyici DNT elementlərinin qrupları olan super gücləndiricilər və lncRNA-lar arasındakı hüceyrə qarşılıqlı təsirlərini aşkar etməyi hədəfləyiblər.

Tədqiqatçılar müxtəlif transkriptomik üsullardan istifadə edərək ümumilikdə 1344 lncRNA müəyyən etdilər. Bu lncRNA-lardan IGF1R lokusundakı IGF1R-AS1 adlanan antisens lncRNA-nın super gücləndiricilərlə ən güclü əlaqə nümayiş etdirdiyini aşkar etdilər.

Hesablama təhlili və genlərin dekompozisiyası təcrübələri vasitəsilə alimlər həmçinin IGF1R-AS1-in yalnız şiş toxumasında ifadə olunduğunu və normal sağlam toxumada deyil, xüsusilə prostat və ağciyər xərçəngi hüceyrələrində həddindən artıq ifadə olunduğunu aşkar etdilər.

Bundan əlavə, onlar IGF1R-AS1-in xromatin strukturunu və gen ifadəsini tənzimləyən xromatin remodelinq kompleksləri ilə, eləcə də genomun təşkilini formalaşdıran ixtisaslaşmış zülallar sinfi olan memarlıq zülalları ilə birbaşa qarşılıqlı təsir göstərdiyini aşkar etdilər.

Yanqın sözlərinə görə, bu qarşılıqlı təsir onkogen MYC-nin gücləndiriciləri ilə onun promotor bölgəsi arasında xromatin döngəsini təşviq edir ki, bu da MYC-nin həddindən artıq ifadəsinə və şişin irəliləməsinə səbəb olur.

“Görünür, bu lncRNA, 8-ci xromosomda gücləndirici ilə MYC promotoru arasında MYC-nin həddindən artıq ifadəsini tetiklemek üçün bir döngə yaratmaqda mərkəzi rol oynayır”, – deyə Yanq bildirib. “Bildiyimiz qədəri ilə, uzun mənzilli xromatin qarşılıqlı təsirləri vasitəsilə MYC ifadəsini tənzimləyən fərqli bir xromosomda yerləşən bir lncRNA müəyyən etdiyimiz ilk dəfədir.”

Tapıntılar göstərir ki, IGF1R-AS1 prostat və ağciyər xərçəngi də daxil olmaqla, MYC-dən qaynaqlanan xərçənglərin inkişafını idarə etməyə kömək edir və əvvəllər dərmanla müalicə olunmayan MYC üçün potensial terapevtik hədəfi ortaya qoyur.

“Bu, lncRNA-nı hədəf alaraq MYC-ni hədəf almağın yolu ola bilər, çünki lncRNA MYC ifadəsini aktivləşdirmək üçün bir düymə kimi görünür. Əgər bir şəkildə lncRNA-nı hədəf ala bilsək, onda şiş böyüməsinə səbəb olmaması üçün MYC siqnalını dolayı yolla bağlaya bilərik. lncRNA-nın özünün də müəyyən proqnostik potensialı var, çünki biz lncRNA ifadəsini bir çox xərçəng növündə sınaqdan keçiririk”, – deyə Yanq bildirib.

Yanqın sözlərinə görə, bu işin növbəti addımları digər şişə xas lncRNA-ların müəyyən edilməsini və onların digər xəstəliklərdə onkogen siqnal yollarına necə təsir etdiyini müəyyən etməyi əhatə edəcək.