#Mikrobiom #Xəbərlər

Vesikül proteomikası yeni yük zülallarını və hüceyrə nəqlində köməkçi amilləri aşkar edir

Honq Konq Elm və Texnologiya Universiteti tərəfindən

Gaby Clark tərəfindən redaktə edilmiş , Robert Eqan tərəfindən nəzərdən keçirilmişdir

 Redaktorların qeydləriKredit: HKUST

Eukaryotik hüceyrələrdə ifrazat yolu hüceyrə funksiyasını və fizioloji fəaliyyətləri qorumaq üçün çox vacibdir, çünki zülalların xüsusi hüceyrəaltı yerlərə dəqiq nəqlini və ya hüceyrədən kənar sekresiyanı təmin edir. Honq Konq Elm və Texnologiya Universitetinin (HKUST) Həyat Elmləri Bölməsindən Prof. Quo Yusonun rəhbərlik etdiyi tədqiqat qrupu yük zülallarının sekretor yolda daşınma veziküllərinə tanınması və yüklənməsinin molekulyar mexanizmlərini geniş şəkildə araşdırıb.

https://647c257e1d8820bd6deed25de9d5e2bf.safeframe.googlesyndication.com/safeframe/1-0-45/html/container.html

Komanda , yükün yüklənməsinin molekulyar mexanizmlərini parçalamaq üçün güclü alət təmin edərək, xəstəliklə əlaqəli bir çox yük zülallarının qablaşdırmasını ifrazat yolu boyunca veziküllərə uğurla bərpa etdi . Bundan əlavə, onlar veziküllərin zülal tərkibinin və morfoloji xüsusiyyətlərinin sistematik identifikasiyasına imkan verən elektron mikroskopiya və proteomika ilə veziküllərin bərpasını birləşdirən innovativ analiz platforması hazırlayıblar . Bu hərtərəfli yanaşma yeni yük müştərilərinin və vezikulyar alverə vasitəçilik edən hüceyrə faktorlarının aşkar edilməsində effektivliyini sübut etdi.

Professor Quonun rəhbərlik etdiyi tədqiqat qrupu Honq Konq Politexnik Universitetində (PolyU) professor Yao Zhong-Ping komandası ilə əməkdaşlıq edərək öz nəticələrini Milli Elmlər Akademiyasının Protokollarında dərc edib . Bu tədqiqat AP-1 və AP-4 adapter zülal komplekslərinin vasitəçilik etdiyi nəqliyyat yüklərini sistematik şəkildə müəyyən etmək üçün kəmiyyət kütlə spektrometriyası ilə in vitro veziküllərin yenidən qurulmasını birləşdirir. O, həmçinin AP-4 vasitəçiliyi ilə vezikül ticarətində iştirak edən əsas sitozolik tənzimləyici amilləri aydınlaşdırır.

İfraz yolu daxilində trans-Golgi şəbəkəsi (TGN) zülalları dəqiq şəkildə nəqliyyat veziküllərinə qablaşdıraraq mərkəzi çeşidləmə mərkəzi rolunu oynayır. Çeşidləmə xətaları yüklərin düzgün hədəflərinə çatmasına mane ola bilər, hüceyrə polaritesi, immun funksiyası və digər fizioloji proseslərdə qüsurlara səbəb olur.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=8188791252&adk=1645945215&adf=308666314&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1761196749&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-10-vesicle-proteomics-uncover-cargo-proteins.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&aieuf=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTQxLjAuNzM5MC41NSIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJHb29nbGUgQ2hyb21lIiwiMTQxLjAuNzM5MC41NSJdLFsiTm90P0FfQnJhbmQiLCI4LjAuMC4wIl0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjE0MS4wLjczOTAuNTUiXV0sMF0.&abgtt=6&dt=1761196749670&bpp=1&bdt=164&idt=51&shv=r20251021&mjsv=m202510210101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1761196486%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1761196486%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3D1241933dda87baba%3AT%3D1750839581%3ART%3D1761196486%3AS%3DAA-AfjZwPuiSAour3k16ZA1JtXua&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=3737877962218&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=4&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2123&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31095143%2C31095300%2C31095351%2C42532524%2C95373974%2C95374047%2C95374288%2C95374626%2C95375702%2C95376000%2C31095372&oid=2&pvsid=3236141255132133&tmod=674931755&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&plas=164x742_l%7C164x742_r&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=1&fsb=1&dtd=297

TGN-də zülalların çeşidlənməsi ilə məşğul olan əsas amillər adapter zülal (AP) kompleksləri, AP-1 və AP-4-dür. Onların genlərindəki mutasiyalar bir neçə insan xəstəlikləri ilə sıx bağlıdır: AP1S1 mutasiyaları (AP-1-in σ1 alt vahidini kodlayan) MEDNIK sindromu ilə əlaqələndirilir; AP1S2 mutasiyaları X ilə əlaqəli əqli qüsura səbəb ola bilər; və hər hansı AP-4 alt bölməsində mutasiyalar mürəkkəb irsi spastik paraplegiya olan “AP-4 çatışmazlığı sindromuna” gətirib çıxarır.

Buna görə də, AP-1 və AP-4-ün yük müştərilərinin müəyyən edilməsi onların fizioloji və patoloji rollarını başa düşmək üçün çox vacibdir. Bununla belə, onların vasitəçilik etdikləri yüklərin və kofaktorların tam repertuarı qeyri-müəyyən olaraq qalır. Xüsusilə, AP-4 vasitəçiliyi ilə TGN ixracının klatrindən asılı olmadığı görünür və veziküllərin formalaşması hələ müəyyən edilməmiş əlavə amillərdən asılı ola bilər.

Bu işdə Prof. Quonun komandası AP1γ1 və ya AP4ε nokaut hüceyrələrindən, təcrid olunmuş vezikül fraksiyalarından istifadə edərək vezikül əmələ gəlməsi təhlillərini həyata keçirdi və kəmiyyət kütlə spektrometriyası ilə proteom geniş təhlilini apardı. Bu yanaşma onlara TGN-dən ixrac edilən AP-1- və AP-4-dən asılı yük zülallarını, həmçinin AP-4- vasitəçiliyi ilə daşınma üçün tələb olunan əsas sitozolik əlavə amilləri müəyyən etməyə imkan verdi. Sonrakı biokimyəvi yoxlamalar CAB45-in AP-1-dən asılı yük olduğunu, ATRAP-ın (angiotenzin II tip I reseptoru ilə əlaqəli zülal) AP-4-dən asılı yük olduğunu ortaya qoydu. Qeyd edək ki, AP-4, ATRAP-ın sitozolik ucunda tirozin əsaslı motivi tanıyaraq, onun Golgidən nəqliyyat veziküllərinə yüklənməsinə vasitəçilik edir.

Gündəlik anlayışlar üçün Phys.org-a etibar edən 100.000-dən çox abunəçi ilə elm, texnologiya və kosmosda ən son yenilikləri kəşf edin . Pulsuz xəbər bülleteni üçün qeydiyyatdan keçin və mühüm nailiyyətlər, yeniliklər və tədqiqatlar haqqında gündəlik və ya həftəlik yeniləmələr əldə edin .

Tədqiqat həmçinin WDR44 və PRRC1 sitozolik zülallarının AP-4 vasitəçiliyi ilə yüklərin çeşidlənməsində kritik rol oynadığını aşkar etdi. WDR44 səviyyələri yıxıldıqda, AP-4 yükü ATG9A Golgidə anormal şəkildə yığıldı. Eynilə, PRRC1 nokautu ATG9A-nın endoplazmik retikulumda saxlanmasına səbəb olaraq hüceyrə autofagiyasını pozdu. Digər AP-4 yükü ATRAP da bu şərtlər altında Qoljidə toplanmışdı.

“Bu nəticələr AP-1 və AP-4-ün sekretor alverində funksiyaları haqqında anlayışımızı dərinləşdirməklə yanaşı, həm də xüsusi köməkçi amillərin mexanizmlərinin sistematik şəkildə tədqiqi üçün güclü metodoloji alətlər dəsti təmin edir” dedi Prof. Quo.

Tədqiqatın həmmüəllifləri HKUST-dən Prof. Guo və PolyU-dan Prof. Yaodur. HKUST-də doktorluqdan sonrakı tədqiqatçı Dr. Peng Ziqing ilk müəllifdir.

Daha çox məlumat: Ziqing Peng et al, vezikül proteomikası vasitəsilə AP-1 və AP-4-ün yük müştərilərinin və aksesuar amillərinin aşkarlanması, Milli Elmlər Akademiyasının əsərləri (2025). DOI: 10.1073/pnas.2508961122

Jurnal məlumatı: Milli Elmlər Akademiyasının Materialları 

Honq Konq Elm və Texnologiya Universiteti tərəfindən təmin edilmişdir 

Download QRPrint QR

Leave a comment

Sizin e-poçt ünvanınız dərc edilməyəcəkdir. Gərəkli sahələr * ilə işarələnmişdir