Toribio Rodríguez de Mendoza Milli Universitetinin tədqiqatçıları Perunun şimalından gələn gözəl aromalı kakaonun genomik analizini apararaq, Theobroma kakaonunda genetik fərqlilik və təkamül nümunələrini aşkara çıxarıblar.

Kakao (Theobroma cacao) qlobal əhəmiyyətli bir məhsuldur, lakin məhdud molekulyar məlumatlara görə onun intraspesifik genetik əlaqələri həll olunmamış qalır. Ənənəvi təsnifatlar kakaonu Forastero, Criollo və Trinitario növlərinə ayırır, lakin genetik tədqiqatlar göstərir ki, Cənubi Amerikadakı kakao populyasiyaları bu kateqoriyalara tam uyğun gəlmir. İncə aromalı kakao, yüksək qiymətli çeşid, fərqli dad profilinə görə tanınır, lakin onun təkamül tarixi və genetik quruluşu tam olaraq xarakterizə edilməmişdir.

Tək nukleotid polimorfizmləri (SNPs) və mikrosatellitlər kimi molekulyar markerlər kakao genetikasını öyrənmək üçün istifadə edilmişdir, lakin xloroplast genomu məlumatları azdır. Plastid genomları ana nəslini və təkamül divergensiyasını başa düşmək imkanı verir və onları gözəl aromatik kakaonun genetik quruluşunu və tarixi inkişafını anlamaq üçün dəyərli vasitəyə çevirir.

PLOS ONE -da dərc olunan “Şimali Perunun Theobroma kakao xloroplast genomlarının müqayisəli təhlili” adlı araşdırmada tədqiqatçılar genetik variasiyanı araşdırmaq, potensial nəsil markerlərini müəyyən etmək və fərqlilik vaxtlarını təxmin etmək üçün xloroplast genom analizi aparıblar.

Perunun şimalındakı Bagua və Utcubamba əyalətlərindən yeddi gözəl aromalı kakao genotipi toplanmış, nümunələr KUELAP herbariumunda saxlanılmışdır. Genom ölçüləri 160,589 ilə 160,727 əsas cüt arasında dəyişdi, GC tərkibi 36,9% təşkil etdi. Müqayisəli təhlil bütün incə aromalı kakao nümunələrində infA geninin mövcudluğunu aşkar etdi, bu xüsusiyyət əvvəllər dərc edilmiş T. kakao genomlarında yoxdur.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=188&slotname=8188791252&adk=1687169288&adf=4054963813&pi=t.ma~as.8188791252&w=750&abgtt=6&fwrn=4&lmt=1742360589&rafmt=11&format=750×188&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2025-03-maternal-lineages-fine-aroma-cocoa.html&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM0LjAuNjk5OC44OSIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJDaHJvbWl1bSIsIjEzNC4wLjY5OTguODkiXSxbIk5vdDpBLUJyYW5kIiwiMjQuMC4wLjAiXSxbIkdvb2dsZSBDaHJvbWUiLCIxMzQuMC42OTk4Ljg5Il1dLDBd&dt=1742360589257&bpp=1&bdt=132&idt=41&shv=r20250305&mjsv=m202503130101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Df22668bce9793ae4%3AT%3D1735196613%3ART%3D1742360254%3AS%3DALNI_Mb4Xpwl1SO1AcvqroR6xccDm_sheQ&gpic=UID%3D00000f7c5320f40b%3AT%3D1735196613%3ART%3D1742360254%3AS%3DALNI_Mb1dz_DHiT2yDzXLMaB9CDkQl4XGg&eo_id_str=ID%3Dcdf7f2f01784f52d%3AT%3D1735196613%3ART%3D1742360254%3AS%3DAA-Afjb8kbeupLLyQ0QHQmZxpM4v&prev_fmts=0x0%2C1200x280&nras=1&correlator=5429484958585&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=3&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=1995&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=31090357&oid=2&pvsid=2928006446436335&tmod=1320504306&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&btvi=2&fsb=1&dtd=43

Filogenetik analiz incə aromalı kakao nəsilləri arasında üç fərqli genetik qrup müəyyən etdi, bunlardan biri Trinitario və Criollo sortları ilə, digəri Aşağı Amazondan olan Forastero ilə, üçüncüsü isə Milli və Curaray genetik qrupları ilə əlaqələndirilir. Ycf1 genindəki əhəmiyyətli dəyişiklik onun gözəl aromatik kakao soylarını ayırd etmək üçün faydalı olduğunu göstərir.

Divergensiya vaxtı təxminləri göstərir ki, Theobroma kakao və Theobroma grandiflorum ~ 10,11 milyon il əvvəl ortaq əcdadları paylaşmış, Theobroma kakao isə təxminən 7,55 milyon il əvvəl ayrılmışdır. İncə aromalı kakao populyasiyaları çox güman ki, Pleistosen dövründə (~ 0,31-1,82 milyon il əvvəl) şaxələnmişdir.

Tapıntılar incə aromalı kakaonun genetik quruluşu və təkamül tarixi haqqında yeni anlayışlar təmin edir. Ycf1 kimi soy-xüsusi markerlərin müəyyən edilməsi yetişdirmə proqramlarında, qorunma səylərində və Theobroma kakaonun genetik təsnifatında kömək edə bilər.

Daha çox məlumat: Daniel Tineo və digərləri, Perunun şimalından Theobroma kakao xloroplast genomlarının müqayisəli təhlili, PLOS ONE (2025). DOI: 10.1371/journal.pone.0316148

Jurnal məlumatı: PLoS ONE 

© 2025 Science X Network