San Dieqo Kaliforniya Universitetinin elektrik mühəndislərinin rəhbərlik etdiyi tədqiqatçılar bütün genomların müqayisəli analizini yerinə yetirmək üçün daha yaxşı üsul hazırlayıblar. Bu yanaşma geoloji zaman miqyasında müxtəlif növlər arasındakı əlaqələri öyrənmək üçün istifadə edilə bilər.

Bu yeni yanaşma təkamülün müasir genomları necə formalaşdırdığı və həyat ağacının necə təşkil edildiyi ilə bağlı kəşfləri açmağa hazırlaşır. CASTER adlı yeni üsul 23 yanvar 2025-ci ildə Science jurnalında dərc olunmuş məqalədə təsvir edilmişdir .

CASTER bioloqlara tam genomları müqayisə etmək üçün ən müasir texnologiyalardan daha geniş miqyaslı yanaşma təklif etməyə hazırdır. Bu, həm canlı, həm də nəsli kəsilmiş növlərin ardıcıl genomlarının artan sayını nəzərə alaraq xüsusilə aktualdır .

Bütün bu genomlar filogenomik analizlər vasitəsilə müqayisəli tədqiqat üçün mövcuddur . CASTER bioloqlara təkcə növ əlaqələrini deyil, həm də genom üzrə təkamül tarixinin mozaikasını anlamağa kömək edəcək şərh edilə bilən nəticələr təqdim edir .

“2000-ci illərin əvvəllərindən bəri saysız-hesabsız tədqiqatlar “genom miqyasında” filogeniyanın yenidən qurulmasını iddia etdi; lakin bunların hamısı genomlar arasında səpələnmiş subnümunə alma bölgələrinə əsaslanır və hər hansı bir tədqiqatın bir hissəsi olan hər tam genomun yalnız kiçik bir hissəsini təşkil edir. Mürəkkəb modellərdən istifadə edərkən bütün genomik mövqeləri təhlil etmək əlçatmaz görünürdü “dedi Siavaş Mirarab, UC San Diego-da elektrik mühəndisliyi professoru və Elmi məqalənin müvafiq müəllifi .

“Məni həyəcanlandıran odur ki, biz indi geniş istifadə olunan hesablama resursları ilə növlər arasında uyğunlaşdırılmış hər bir baza cütündən istifadə edərək, həqiqətən geniş genom analizləri həyata keçirə bilirik.”

“Bu mərhələyə gəlmək statistika, kompüter elmləri və biologiya da daxil olmaqla bir çox fənlərin birgə səylərini tələb etdi ” dedi məqalənin ilk müəllifi Chao Zhang.

Zhang doktorluq dissertasiyasını tamamladı. UC San Diego-da Bioinformatika və Sistem Biologiyası proqramında. O, hazırda Kopenhagen Universitetinin fakültəsindədir.

Daha çox məlumat: Chao Zhang et al, CASTER: Bütün genom uyğunlaşmalarından birbaşa növ ağacın nəticəsi, Elm (2025). DOI: 10.1126/science.adk9688 . www.science.org/doi/10.1126/science.adk9688

Jurnal məlumatı: Elm 

Kaliforniya Universiteti – San Dieqo tərəfindən təmin edilmişdir