Texas Universitetinin MD Anderson Xərçəng Mərkəzi tərəfindən

redaktə edən: Gaby Clark , rəy verən: Robert Egan

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Qrafik xülasə. Mənbə: Cell Reports Medicine (2026). DOI: 10.1016/j.xcrm.2026.102610

Texas Universitetinin MD Anderson Xərçəng Mərkəzinin tədqiqatçıları şişlərdə gen ifadəsindəki dəyişiklikləri onların unikal mikro mühitlərinə nisbətən daha yaxşı nəzərə almaq üçün hazırlanmış yeni bir hesablama yanaşması hazırlayıblar. Bu yanaşma üçqat mənfi döş xərçəngi (TNBC) xəstələrində kimyaterapiya cavabını proqnozlaşdırmaq üçün mövcud metodlardan daha yaxşı nəticə göstərib.

Bioinformatika və Hesablama Biologiyası professoru, fəlsəfə doktoru Venyi Vanq və həmkarları tərəfindən hazırlanmış yeni alət bu gün Cell Reports Medicine jurnalında dərc edilib . O, hüceyrə fərqlərinin parçalanmasını, hesablanmasını və şərh edilməsini əhatə edən dekonvolyusiya kimi tanınan bir yanaşmadan istifadə edərək müalicə reaksiyalarını proqnozlaşdırmaq üçün oxşar metodları təkmilləşdirməyi hədəfləyir. Bu yanaşma həmçinin TNBC-nin populyasiya səviyyəli xüsusiyyətlərinə dair yeni anlayışlar ortaya qoyub.

Vanq bildirib ki, “Dekonvolyusiya strategiyaları hamıya eyni ölçüdə uyğun deyil. Biz bu metodları geniş hesablama təcrübəsi olmayan tədqiqatçılar üçün daha əlçatan etməyə diqqət yetiririk və məqsədimiz bu güclü analitik yanaşmaları daha geniş xərçəng tədqiqat icmasının qabaqcıl dəqiq tibbdə asanlıqla tətbiq edə biləcəyi praktik vasitələrə çevirməkdir.”

Tədqiqatçılar hazırda müalicə nəticələrini proqnozlaşdırmaq üçün hansı vasitələrə malikdirlər?

Vanq və həmkarları bir çox hesablama vasitəsinin mövcud olduğunu bilərək, bu yaxınlarda bu dekonvolyusiya metodlarından 43-nü ətraflı izah edən əhatəli bir təlimat dərc etdilər. Onların məqsədi geniş hesablama təcrübəsi olmayan tədqiqatçılara tədqiqatlarına xas məqsədləri üçün hansı metodun ən yaxşı işləyə biləcəyini anlamağa kömək etmək idi.

Lakin, mövcud təsnifat strategiyaları hüceyrə tərkibini ölçsə də, şişlərdə gen ifadəsində onların unikal mikro mühitləri ilə əlaqəli olaraq baş verən dəyişiklikləri nəzərə almır .

Bunu həll etmək üçün tədqiqatçılar MD Andersonun Onkologiya üzrə Məlumat Elmləri İnstitutu (IDSO) və Döş Tibbi Onkologiyası Departamenti ilə əməkdaşlıq edərək şişə xas ümumi mRNT ifadəsini (TmS) də nəzərə alan inteqrativ həcm təhlili hazırladılar. Bu yanaşma, xərçəngə xas mexanizmləri müəyyən etmək üçün şiş hüceyrələrinin şiş olmayan hüceyrələrə nisbətini nəzərə alır.

Normal hüceyrələrdə mRNT ifadəsi xromosom sayı ilə birbaşa mütənasib olsa da, xərçəng hüceyrələrində anormal sayda xromosom olur. TmS biomarkeri bunu nəzərə alaraq xərçəng hüceyrələrindəki xromosom sayına nisbətən gen ifadəsi dəyişikliklərini nəzərə alır. Bu biomarker şiş hüceyrələri ilə müqayisədə şiş mikro mühit hüceyrələrində RNT aktivliyindəki dəyişikliklərə əlavə təsir göstərir.

Tədqiqatçılar TmS biomarkerindən istifadə edərək nə aşkar etdilər?

Etnik cəhətdən müxtəlif kohortlarda TNBC xəstəsi olan 575 xəstənin məlumat bazasında TmS biomarkeri xəstələri yüksək TmS və ya əlverişli proqnoza malik və aşağı TmS və ya zəif proqnoza malik olanlara dəqiq şəkildə ayıra bilmişdir.

Biomarker, müalicə seçimini optimallaşdırmaq üçün xəstə təbəqələşməsi üçün effektiv başlanğıc nöqtəsi kimi potensialını vurğulayaraq, kemoterapi reaksiyasını proqnozlaşdırmaq üçün mövcud metodlardan daha yaxşı nəticə göstərdi.

Əhəmiyyətli olan odur ki, bu proqnostik biomarker populyasiyalar arasında tətbiq olunur və eyni zamanda yüksək TmS-li Qərb və Asiya etnik qruplarının şiş mikromühitlərində əsas fərqlərin olduğunu vurğulayır ki , bu da klinisyenlərə hər bir populyasiya üçün daha effektiv işləməsi ehtimal olunan əlavə müalicələri uyğunlaşdırmağa imkan verə bilər.

Bu aləti klinikada inkişaf etdirmək üçün əlavə validasiya tələb olunsa da, bu nəticələr TmS biomarkerinin müxtəlif populyasiyalar arasında müalicə seçimini optimallaşdırmaq üçün perspektivli bir yanaşma olduğunu göstərir.

Nəşr detalları

Yaoyi Dai və digərləri, Şiş mikromühitinin transkripsiya aktivliyi üçqat mənfi döş xərçəngində kimyaterapiya reaksiyasının güclü təbəqələşməsinə imkan verir, Cell Reports Medicine (2026). DOI: 10.1016/j.xcrm.2026.102610

Jurnal məlumatı: Hüceyrə Hesabatları Tibbi 

Əsas tibbi anlayışlar

Üçqat Mənfi Döş Karsinoması

Klinik kateqoriyalar

OnkologiyaTexas Universitetinin MD Anderson Xərçəng Mərkəzi tərəfindən təmin edilir