İctimaiyyətə açıq olan insan təkhüceyrəli gen ifadəsi verilənlər toplusuna və ya scRNA-seq verilənlər bazasına giriş tədqiqatçıların həm mürəkkəb bioloji sistemlər, həm də müxtəlif xəstəliklərin etimologiyası haqqında anlayışını əhəmiyyətli dərəcədə artırmışdır. Bununla belə, əlçatanlığın artması hüceyrələri bağışlayan şəxslərin məxfiliyi və onların şəxsi sağlamlıq məlumatlarının razılıq olmadan paylaşılması ehtimalı ilə bağlı daha çox narahatlıq yaradır.

Bu məxfilik pozuntuları ilə bağlı əvvəlki tədqiqatlar, genlərin orta ifadə səviyyələrinin fərdi hüceyrədən daha çox toxuma və ya nümunədən olan böyük bir hüceyrə populyasiyasında ölçüldüyü toplu gen ifadəsi məlumatlarının paylaşılmasına yönəlmişdir . Tək hüceyrəli verilənlər dəstləri çoxlu variasiya və ya “səs-küy” ehtiva edə bildiyi üçün tədqiqatçılar onları məlumat sızması üçün yüksək risk altında hesab etmirdilər.

İndi Nyu-York Genom Mərkəzi, Kolumbiya Universiteti və Braun Universitetinin tədqiqatçıları bu fərziyyəyə etiraz ediblər.

Oktyabrın 2-də Cell-də nəşr olunan yeni bir araşdırma , tək hüceyrəli gen ifadəsi verilənlər bazasındakı fərdlərin “bağlayıcı hücumlara” qarşı həssas olduqlarına dair yeni kəşfi təsvir edir. Bu cür hücumlarda hakerlər tədqiqat iştirakçılarının şəxsi genetik və fiziki xüsusiyyətlərini aşkar edə bilərlər.

“Bu yaxınlarda buraxılmış populyasiya miqyasında tək hüceyrəli məlumat dəstləri məxfiliyin sızması mövzusuna yaxınlaşmağa və hakerin yalnız xəstənin genetik quruluşu və genetik quruluşu haqqında məlumat əldə etmək üçün açıq məlumatlardan istifadə edərək tək hüceyrəli məlumatların səs-küyü ilə işləyə biləcəyi sualını həll etməyə imkan verdi. fenotipik xüsusiyyətlər və xəstəliklər”, – müxbir müəllif, Ph.D., Nyu-York Genom Mərkəzinin (NYGC) əsas fakültəsinin üzvü və Kolumbiya Universitetində biotibbi informatika üzrə köməkçi professor Herbert İrvinq.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=183&slotname=8188791252&adk=2823516881&adf=1857921027&pi=t.ma~as.8188791252&w=730&abgtt=6&fwrn=4&lmt=1728969652&rafmt=11&format=730×183&url=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fnews%2F2024-10-method-quantifies-cell-private-leakage.html&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTUuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTI5LjAuNjY2OC45MCIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJHb29nbGUgQ2hyb21lIiwiMTI5LjAuNjY2OC45MCJdLFsiTm90PUE_QnJhbmQiLCI4LjAuMC4wIl0sWyJDaHJvbWl1bSIsIjEyOS4wLjY2NjguOTAiXV0sMF0.&dt=1728836015556&bpp=1&bdt=3571&idt=105&shv=r20241009&mjsv=m202410090101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3Ddd084782a3980897%3AT%3D1725971170%3ART%3D1728969557%3AS%3DALNI_Ma1uv12HX_ctV-7loP2Dla_dLGslw&eo_id_str=ID%3D6cdee71e935b6dcb%3AT%3D1725971170%3ART%3D1728969557%3AS%3DAA-AfjZEH1DAbfRV50frmhACTroQ&prev_fmts=0x0%2C730x280%2C928x1012&nras=2&correlator=5500772594282&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=1&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=457&ady=1909&biw=1903&bih=859&scr_x=0&scr_y=0&eid=44759875%2C44759926%2C44759837%2C31087802%2C31087890%2C44795922%2C95331832%2C95343454%2C95344777%2C31087977%2C95337196&oid=2&psts=AOrYGsmMgtRg3dMqcipIlXOnAypnWx3QwRjchdeV-yjtsBdNrFM9CC6NWKjK-e48FmJ0O0uNJFdD2uTXY6dtLjft6sC0gtE&pvsid=1386853698468019&tmod=982980137&uas=0&nvt=3&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2Fsort%2Fdate%2Fall%2Fpage8.html&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C859&vis=1&rsz=%7C%7CpEebr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=0&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=3&uci=a!3&btvi=1&fsb=1&dtd=M

Dr. Gürsoy və tədqiqat müəllifləri əvvəlcə bir Lupus tədqiqatından və OneK1K kohortundan məlumat topladılar, fərdləri onların genetik və fenotipik məlumatları ilə əlaqələndirərək, onları ictimaiyyətə açıq olan toplu ifadə kəmiyyət xüsusiyyətləri lokusları (eQTLs) ilə müqayisə etdilər.

Sonra onlar nümayiş etdirdilər ki, bu əlaqə hüceyrə tipli xüsusi eQTL-lərdən istifadə etməklə daha dəqiq həyata keçirilə bilər. Nəhayət, onlar göstərdilər ki, fərdləri onların genetik və fenotipik profilləri ilə əlaqələndirmək hələ də eQTL məlumatlarının mövcud olmadığı hallarda, proqnozlaşdırıcı modeli öyrətmək üçün daha az sayda fərddən genetik və tək hüceyrəli məlumatlardan istifadə etməklə mümkündür.

NYGC və Kolumbiyada Dr. Gürsoyun laboratoriyalarında keçmiş post-doc Conor Walker əlavə edir: “Biz hamımız bilirik ki, gen ifadə modelləri genetik mutasiyalardan təsirlənir , onların birləşmələri hər bir fərd üçün unikaldır”.

“Biz göstərdik ki, bir kohortdan genetik variantlardan və təkhüceyrəli RNT-Seq məlumatlarından istifadə etməklə, yalnız həmin tədqiqatlardan əldə edilən tək hüceyrəli ifadə məlumatlarına əsaslanaraq, digər tədqiqatlarda proqnozlaşdırıla bilən mövqeləri müəyyən edə bilərik. Bu yanaşma axtarışa imkan verir. əlaqəli olmayan tədqiqatların iştirakçılarının paylaşmağa heç vaxt razılıq vermədiyi genetik məlumat.”

Verilənlərin eyni qrupdan və ya populyasiyadan qaynaqlanması lazım olmadığından, sağlam məlumat dəstləri xəstə verilənlər toplusu haqqında məlumatı proqnozlaşdırmaq üçün istifadə edilə bilər. Sağlam və xəstə insanların gen ifadələrində kifayət qədər əsas ümumi cəhətlər var ki, xəstəlik tək hüceyrələrdə belə gen ifadə siqnallarına böyük təsir göstərmir .

“Fərqli bir laboratoriyada yaradılan və hətta fərqli bir üsulla işlənmiş məlumatlardan istifadə etmək, daha sonra tamamilə fərqli bir anonim məlumat dəstində fərdləri əlaqələndirmək üçün istifadə etmək bacarığı olduqca təəccüblüdür və bir hüceyrəli məlumatlar üçün əsl məxfilik problemini vurğulayır” dedi. Gürsoy Dr. “Biz bu araşdırmanı məlumatların yayılmasından əvvəl riskləri ölçməyə kömək etmək və xəstələr üçün daha çox məxfiliyi təmin etmək üçün gələcək tədqiqatların dizaynını formalaşdırmaq məqsədi daşıyırıq.”

Ümid edirik ki, bu kəşf təkhüceyrəli məlumatların donorları üçün məxfilik riskini vurğulayan aydın və ətraflı razılıq siyasətlərinin işlənib hazırlanmasına və təcavüzkarların bu məlumatdan zərər üçün istifadəsinin qarşısını alan qanunların və qanunvericiliyin formalaşmasına kömək edəcək.

Ətraflı məlumat: Tək hüceyrəli matrislərdən şəxsi məlumat sızması, Cell (2024). DOI: 10.1016/j.cell.2024.09.012 . www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01030-4

Jurnal məlumatı: Cell 

Nyu York Genom Mərkəzi tərəfindən təmin edilmişdir