Alman Neyrodegenerativ Xəstəliklər Mərkəzi tərəfindən

Gaby Clark tərəfindən redaktə edilmişdir , Andrew Zinin tərəfindən nəzərdən keçirilmişdir

 Redaktorların qeydləriγ-sekretaz substratının parçalanma bölgəsinin ardıcıl analizi. Kredit: Nature Communications (2025). DOI: 10.1038/s41467-025-60638-z

DZNE, Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU) və Münhen Texniki Universitetinin (TUM) tədqiqatçıları müəyyən etdilər ki, Alzheimer xəstəliyi və xərçəngdə iştirak edən “qamma-sekretaz” fermenti molekulyar xüsusiyyətlərin kompleks sxeminə uyğun olaraq reaksiya tərəfdaşlarını seçir.

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=7587637799&adk=1434173251&adf=4198688998&pi=t.ma~as.7587637799&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1752134251&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fmedicalxpress.com%2Fnews%2F2025-07-ai-method-enzyme-linked-alzheimer.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM4LjAuNzIwNC45NyIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJOb3QpQTtCcmFuZCIsIjguMC4wLjAiXSxbIkNocm9taXVtIiwiMTM4LjAuNzIwNC45NyJdLFsiR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzOC4wLjcyMDQuOTciXV0sMF0.&dt=1752134251271&bpp=1&bdt=333&idt=37&shv=r20250708&mjsv=m202507070101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3De77740426f8da9bc%3AT%3D1735295852%3ART%3D1752133889%3AS%3DALNI_MbHbvhLj3WydQ3lYshQhNgDg8E9nQ&gpic=UID%3D00000f80ad9e2337%3AT%3D1735295852%3ART%3D1752133889%3AS%3DALNI_MYM9zSDwUrvOLsQ-H1E20L0IjGeMw&eo_id_str=ID%3Df152d1a4517561f1%3AT%3D1751526315%3ART%3D1752133889%3AS%3DAA-AfjYXsAMYxawkCSjU_EMOR4gg&prev_fmts=0x0&nras=1&correlator=4690477593338&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=1&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=916&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=95353387%2C95362655%2C95365235%2C95365460%2C31093358%2C95359266%2C95365798%2C31093116&oid=2&pvsid=8297075215673745&tmod=1178522494&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=2&rsz=%7C%7CpeEr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=2&uci=a!2&fsb=1&dtd=171

Onların Nature Communications -da dərc olunan tədqiqatı izah edilə bilən süni intellekt (AI) ilə biokimyanı birləşdirərək fermentin tanınması məntiqini deşifrə edən metodologiya təqdim edir. Bu yeni yanaşma xəstəliklərdə qamma-sekretazanın rolunu daha yaxşı başa düşməyə və dərmanların inkişafına kömək edə bilər .

Qamma-sekretaz, Alzheimer xəstəliyi və xərçəngdə əsas rol oynayan “proteazlar” kateqoriyasına aid bir fermentdir. O, neyronlar da daxil olmaqla çoxsaylı hüceyrələrin membranında baş verir, burada bir qayçı kimi hərəkət edərək membrana bağlı digər zülalları parçalayır.

Alzheimer xəstəliyi kontekstində bu, sözdə amiloid prekursor zülalı ilə baş verir. Bununla belə, ferment çox yönlüdür: Onun 150-dən çox məlum hədəfi var, buna “substratlar” da deyilir. İndiyə qədər qamma-sekretazanın bu xüsusi molekulları parçalama səbəbi sirr olaraq qalırdı.

“Əksər proteazlardan fərqli olaraq, qamma-sekretaz aydın ardıcıllıq motivinə müraciət etmir. Bu, ənənəvi hesablama metodlarından istifadə etməklə onun reaksiya tərəfdaşlarını proqnozlaşdırmağı çətinləşdirir,” DZNE və LMU-da tədqiqat qrupunun rəhbəri professor Harald Steiner deyir.

Birgə səy

Bu maneəni aradan qaldırmaq üçün DZNE, LMU və TUM alimləri hesablama biologiyası , membran biokimyası və neyrodegenerasiya tədqiqatları sahəsində təcrübəyə malik fənlərarası komandanı bir araya gətirərək güclərini birləşdirdilər .

“Biz zülalı qamma-sekretazın hədəfinə çevirən şeyin nə olduğunu anlamaq istədik. Zülal ardıcıllığında nümunələr axtarmaq əvəzinə , biz Müqayisəli Fiziki-kimyəvi Profilləşdirmə və ya qısaca CPP adlandırdığımız yeni süni intellektə əsaslanan metod hazırladıq. Bu yanaşmadan istifadə edərək, gizli oxşarlıqları tapmaq üçün məlum substratların fiziki və kimyəvi xassələrini təhlil etdik.” Dr. cari nəşr.

“Bizim metodologiya izah edilə bilən AI adlanan şeyi təmin edir. O, təkcə hədəflər haqqında proqnozlar verməyə imkan vermir, həm də onların arxasında duran məntiqi anlamağa kömək edir.”

https://googleads.g.doubleclick.net/pagead/ads?gdpr=0&us_privacy=1—&gpp_sid=-1&client=ca-pub-0536483524803400&output=html&h=280&slotname=7099578867&adk=1328126233&adf=1100001614&pi=t.ma~as.7099578867&w=750&abgtt=6&fwrn=4&fwrnh=0&lmt=1752134255&rafmt=1&armr=3&format=750×280&url=https%3A%2F%2Fmedicalxpress.com%2Fnews%2F2025-07-ai-method-enzyme-linked-alzheimer.html&fwr=0&rpe=1&resp_fmts=3&wgl=1&uach=WyJXaW5kb3dzIiwiMTkuMC4wIiwieDg2IiwiIiwiMTM4LjAuNzIwNC45NyIsbnVsbCwwLG51bGwsIjY0IixbWyJOb3QpQTtCcmFuZCIsIjguMC4wLjAiXSxbIkNocm9taXVtIiwiMTM4LjAuNzIwNC45NyJdLFsiR29vZ2xlIENocm9tZSIsIjEzOC4wLjcyMDQuOTciXV0sMF0.&dt=1752134251270&bpp=1&bdt=331&idt=50&shv=r20250708&mjsv=m202507070101&ptt=9&saldr=aa&abxe=1&cookie=ID%3De77740426f8da9bc%3AT%3D1735295852%3ART%3D1752134251%3AS%3DALNI_MbHbvhLj3WydQ3lYshQhNgDg8E9nQ&gpic=UID%3D00000f80ad9e2337%3AT%3D1735295852%3ART%3D1752134251%3AS%3DALNI_MYM9zSDwUrvOLsQ-H1E20L0IjGeMw&eo_id_str=ID%3Df152d1a4517561f1%3AT%3D1751526315%3ART%3D1752134251%3AS%3DAA-AfjYXsAMYxawkCSjU_EMOR4gg&prev_fmts=0x0%2C750x280%2C336x280%2C1905x945&nras=2&correlator=4690477593338&frm=20&pv=1&rplot=4&u_tz=240&u_his=1&u_h=1080&u_w=1920&u_ah=1032&u_aw=1920&u_cd=24&u_sd=1&dmc=8&adx=448&ady=2704&biw=1905&bih=945&scr_x=0&scr_y=0&eid=95353387%2C95362655%2C95365235%2C95365460%2C31093358%2C95359266%2C95365798%2C31093116&oid=2&psts=AOrYGsnlQHFg1NZi2ayuUiaqdQIb1Fo5BCZwsZHRDeWfVbLgND5Uklle1EnuBPYnSDMWT0dP4HPJeHLLg_tWzKo%2CAOrYGsluRT8kXaWarf3KixQg_Be-XFT989d8AIMBWr87ZE78KiaqNWfSiDx3sLq84kKO5M_Myei7IhaSGveYl0RqeVLsZcaq&pvsid=8297075215673745&tmod=1178522494&uas=0&nvt=1&ref=https%3A%2F%2Fphys.org%2F&fc=1920&brdim=0%2C0%2C0%2C0%2C1920%2C0%2C1920%2C1032%2C1920%2C945&vis=1&rsz=%7C%7CpeEbr%7C&abl=CS&pfx=0&fu=128&bc=31&bz=1&td=1&tdf=2&psd=W251bGwsbnVsbCxudWxsLDNd&nt=1&ifi=3&uci=a!3&btvi=1&fsb=1&dtd=4085

Dinamik strukturlar

Hazırkı tapıntılar göstərir ki, qamma-sekretazın substratları parçalanma yerinin yaxınlığında fərqli fiziki-kimyəvi imzaya malikdir. Yerli spiral quruluşa əlavə olaraq, bu, fermentin substrata bağlandığı zaman alternativ uyğunlaşmaların qəbul edilməsi potensialını ehtiva edir . Bu dinamik xüsusiyyətlər hüceyrə membranının xüsusi mühitində molekulyar tanınması üçün vacib görünür.

“Bu, əhəmiyyətli xüsusiyyətdir, baxmayaraq ki, qeyri-substratlardan yeganə fərq deyil. Tapdığımız kimi, qamma-sekretazanın substratları bütün fiziki-kimyəvi xassələrin cəmi ilə müəyyən edilir” dedi Breimann.

Bu yeni yanaşma vasitəsilə 160 zülal potensial substrat kimi müəyyən edilib. Bunların heç biri əvvəllər qamma-sekretaz ilə əlaqəli deyildi. Bu zülallardan 11-i, o cümlədən immun tənzimlənməsi və xərçənglə əlaqəli bəziləri, hazırkı tədqiqatda substrat kimi artıq eksperimental olaraq təsdiq edilmişdir.

Outlook

Patoloji prosesin baş verə biləcəyi hüceyrə membranında fermentin olması səbəbindən mövcud tapıntılar xəstəliklərdə qamma-sekretazanın rolunu daha yaxşı başa düşməyə kömək edə bilər. Bununla belə, tədqiqatçılar işlərinin təsirinin bu xüsusi fermentdən kənara çıxdığını vurğulayırlar.

“CPP çərçivəsi digər proteazları və reseptor sistemlərini öyrənmək üçün uyğunlaşdırıla bilər ki, bu da sağlamlıq və xəstəlikdə molekulyar tanınmasını anlamaq üçün güclü bir vasitədir” dedi Steiner. “İrəliyə baxaraq, ümid edirik ki, yanaşmamız daha çox spesifiklik və daha az yan təsirləri olan dərmanların dizaynına kömək edə bilər.”

Daha çox məlumat: Stephan Breimann et al, Charting γ-sekretaz substratları ilə izah edilə bilən AI, Nature Communications (2025). DOI: 10.1038/s41467-025-60638-z

Jurnal məlumatı: Nature Communications Alman Neyrodegenerativ Xəstəliklər Mərkəzi tərəfindən təmin edilmişdir