FAPESP tərəfindən

redaktə edən: Gaby Clark , rəy verən: Robert Egan

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Ümumilikdə 128 növ toksin müəyyən edilmişdir ki, bunlardan 45-i məlum toksinlərdən çox fərqlidir və ya elm tərəfindən heç vaxt təsvir edilməmişdir. Mənbə: CDC / Wikimedia Commons

Braziliyadakı San Paulo Universitetinin (USP) tədqiqatçıları Salmonella bakteriyaları tərəfindən istehsal olunan 45 yeni toksin aşkar ediblər ki, bunlardan bəziləri qida yolu ilə keçən infeksiyalarla əlaqələndirilir. Tədqiqat Bakterial və Bakteriofaq Biologiyası üzrə Tədqiqat Mərkəzində (B3 RIDC) aparılıb və PLOS Biologiya jurnalında dərc edilib . Bu, göstərir ki, bu maddələr əsasən mikroorqanizmlər arasında məkan və resurslar uğrunda rəqabət aparır. Tədqiqat həmçinin göstərir ki, bu maddələr gələcəkdə yeni antibiotiklərin hazırlanmasına, insanlarda dərin tədqiqatlara və biotexnoloji tətbiqlərə ilham verə bilər.

Patogenin istifadə etdiyi mikroskopik arsenalını araşdırmaq üçün komanda Salmonella və onun VI tipli sekresiya sistemindən (T6SS) genetik məlumatları təhlil etdi. Bu sistem bakteriyanın digər hüceyrələrin fəaliyyətinə mane olan toksinlər kimi effektorları ətraf mühitə və ya birbaşa rəqib mikroorqanizmlərə yeritmək üçün istifadə etdiyi nizəyəbənzər sistemdir. Hesablama vasitələrindən istifadə edərək komanda Salmonella enterica-nın 149 müxtəlif serovarından 6165 nümunənin genetik materialını təhlil etdi, potensial toksinləri müəyyən etdi və müxtəlif bakteriyalar arasındakı ardıcıllıqları müqayisə etdi. Onlar həmçinin məlum zülallarla oxşarlıqlarına əsaslanaraq funksiyalarını müəyyən etdilər.

Cəmi 128 növ toksin müəyyən edilib ki, bunlardan 45-i məlum olan hər hansı bir toksindən çox fərqli idi və əvvəllər elm tərəfindən heç vaxt təsvir edilməmişdi. “Bu nəticə göstərir ki, dünya miqyasında bakterial toksinlərin və antitoksinlərin müxtəlifliyi çox yüksəkdir, yeni növlər ortaya çıxır və ya məlum əlaqəli variantlardan kökündən fərqlənir”, – deyə USP-dəki Zülal Quruluşu və Təkamül Laboratoriyasının bioinformatika qrupunun lideri, B3 RIDC-də tədqiqatçı və tədqiqatın müəlliflərindən biri olan Robson Fransisko de Souza izah edir.

Müəyyən edilmiş molekullar müxtəlif yollarla təsir göstərir. Bəziləri digər bakteriyalarla rəqabət aparır, digərləri isə göbələklərin, mayaların, yosunların və hətta məməlilərin hüceyrələrinə təsir göstərir. “Onlardan bəzilərinin insan infeksiyalarında birbaşa rol oynaması mümkündür, lakin bu hipotezi təsdiqləmək üçün hansı ştammın eukaryotları hədəf alan genləri daşıdığını müəyyən etməli və onların hüceyrələrə və infeksiyaya təsirini eksperimental olaraq qiymətləndirməliyik”, – deyə Souza qeyd edir.

Bu müxtəliflik, həmçinin müxtəlif Salmonella qrupları arasında aşkar edilmiş effektorların paylanmasında da əks olunur. Məqalədə göstərilir ki, hər qrup T6SS tərəfindən ifraz olunan unikal molekul kombinasiyasına malikdir. Bu, bakteriyanın ətraf mühit təzyiqlərinə əsasən spesifik effektorları seçdiyini və saxladığını göstərir. Souza bildirir ki, “Bu sistemlərin təkamülü və bu müxtəliflik həm tez-tez yeni toksinlər yaratmaq və aktivləşdirmək üçün baş verən gen rekombinasiyası, həm də bioloji münaqişə ssenarisində bakteriyalar arasında silahlanma yarışını alovlandıran təbii seleksiya ilə idarə olunur”.

Məlumatlar həmçinin göstərir ki, təbii mühitlərdən toplanan Salmonella alt qruplarının xəstələrdən toplananlara nisbətən daha çox effektoru var. Bu, daha çox rəqibin olduğu kontekstlərdə toksin müxtəlifliyinin artdığını göstərir. “Bu, yeni çətinliklər və rəqiblər ortaya çıxdıqca, mikroorqanizmin resurslar üzərindəki bu mübahisələrdə üstün olmaq üçün yeni vasitələr hazırlaması lazım olduğu üçün baş verir”, – deyə Souza izah edir.

Souzanın sözlərinə görə, bu tapıntılar bakteriya rəqabət strategiyaları haqqında anlayışımızı yaxşılaşdırmalı və yeni klinik və biotexnoloji tətbiqlər üçün yol açmalıdır. O, proqnozlaşdırır ki, “Hətta hələ təxmin edə bilmədiyimiz tətbiqlərimiz də ola bilər. Biz buna inanırıq, çünki əvvəlki işlərimizin bəziləri vacib ökaryotik zülalların bakteriya toksinlərindən əmələ gəldiyini göstərib”, o əlavə edir və bu birləşmələrin müxtəlif bioloji kontekstlərdə potensialını vurğulayır.

Souza vurğulayır ki, bu sahə hələ də tükənməyib. O bildirir ki, “Salmonella, Acinetobacter və digər orqanizmlər kimi bakteriyalar hələ də bu toksinlərin ekoloji qarşılıqlı təsirlərdəki rolunu anlamaq üçün imkanlar təqdim edir. Biz bu tip təhlili avtomatlaşdırmaq və tədqiqatı arxeya və daha az tanınan bakteriyalar kimi yeni nəsillərə genişləndirmək üçün proqram təminatı və boru kəmərlərinin hazırlanmasına investisiya qoymağa davam edirik ki, bu da bu tip kəşflər üçün daha çox imkanlar yaradır”.

Nəşr detalları

Gianlucca G. Nicastro və digərləri, Salmonella T6SS effektorlarının sistematik identifikasiyası müxtəlif yeni ailələri və lipid hədəfləmə fəaliyyətlərini aşkar edir, PLOS Biology (2026). DOI: 10.1371/journal.pbio.3003680

Jurnal məlumatları: PLoS Biologiyası