Sanjukta Mondal tərəfindən , Phys.org

Sadie Harley tərəfindən redaktə edilib , Robert Egan tərəfindən nəzərdən keçirilib

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Bakteriyalarda tapılan DRT3 sistemi dəqiq alternativ ardıcıllıqla (poli(GT/AC)) ikiqat zəncirli DNT yarada bilər. Mənbə: Science (2026). DOI: 10.1126/science.aed1656

Stenford Universitetinin alimləri bakteriyalarda tapılan unikal müdafiə sistemi olan DRT3-ün virus infeksiyalarından qorunmaq üçün DNT yaratdığını aşkar ediblər. DRT3 tərs transkriptaza adlanan iki fərqli fermentdən, Drt3a və Drt3b-dən və kodlaşdırmayan RNT-dən (ncRNA) ibarətdir. Bu üçlük birlikdə alternativ təkrarlardan (GT/AC) ibarət uzun, ikiqat zəncirli DNT əmələ gətirir.

İki zülal, Drt3a və Drt3b, DNT-nin iki tamamlayıcı zəncirini sintez etmək üçün fərqli strategiyalardan istifadə edirlər. Drt3a, sistemin ncRNA-sına öz planı kimi yerləşdirilmiş, bu halda ACACAC-ın spesifik, qorunan nuklein turşuları ardıcıllığının surətini çıxarmaq kimi tanış oyun kitabçasına sadiq qalır.

Bu RNT şablonunu birbaşa oxumaqla, müvafiq poli(GT) DNT zəncirini yaradır. Tədqiqatın diqqətəlayiq hissəsi Drt3b tərəfindən istifadə edilən əvvəllər məlum olmayan zülal şablonlaşdırma metodu idi. İkinci zəncirini qurmaq üçün nuklein turşusu şablonuna ehtiyac yoxdur. Bunun əvəzinə, DNT tikinti bloklarının dəqiq bir qaydada əlavə olunmasını təmin etmək üçün öz zülal strukturundan qəlib kimi istifadə edir.

Tapıntılar Science jurnalında dərc olunub .

Şablon olmadan yığma

Uzun müddətdir ki, alimlər fermentlərin DNT və RNT-ni yalnız mövcud nuklein turşusunu şablon kimi izləməklə və ya şablon olmadan qurmaqla qura biləcəyinə inanırdılar. Sonuncu adətən təkrarlanan və ya qısa, proqnozlaşdırıla bilən ardıcıllıqlarla nəticələnirdi.

Bakteriyaları araşdıran alimlər müəyyən ediblər ki, müdafiə ilə əlaqəli tərs transkriptazalar (DRT) bakteriyaların virus infeksiyalarına müqavimət göstərməsinə kömək etmək üçün nuklein turşuları yaratmaq üçün təəccüblü dərəcədə müxtəlif, əvvəllər məlum olmayan metodlardan istifadə edir. Lakin bakteriyaların DRT-lərdən nuklein turşusu şablonu olmadan mürəkkəb, ardıcıllığa xas DNT sintez etmək üçün istifadə edib-etməməsi və əgər belədirsə, hansı mexanizmlərin iştirak etdiyi aydın deyildi.

Bu tədqiqatda komanda araşdırmalarına DRT3 sistemlərini axtaran minlərlə bakteriya ştammının genetik kodlarını araşdırmaqla başladı.

Onlar bunu ən azı 20 fərqli bakteriya növündə tapdılar və burada hər iki Drt3a və Drt3b zülalları demək olar ki, həmişə birlikdə görünür. Sistemin əslində nə etdiyini yoxlamaq üçün onlar DRT3-ü E. coli bakteriyalarına daxil etdilər və onları müxtəlif faqlara və ya viruslara məruz qoydular. Müdafiə mexanizmi düşməni uğurla aradan qaldırdı. Lakin sistem gecə-gündüz işləmədi və yalnız viruslar tərəfindən kodlanan spesifik bir zülal olan ST61 aşkar edildikdə aktivləşdirildi.

Komanda, nəyin istehsal olunduğunu müəyyən etmək üçün DNT ardıcıllığı apardı. Onlar çox spesifik alternativ naxışa malik uzun, təkrarlanan ikiqat zəncirli DNT zəncirləri gördülər.

Krio-elektron mikroskopiyası (krio-EM) ilə istehsal edilən yüksək qətnaməli 3D görüntülər, DRT3-ün altı Drt3a zülalından, altı Drt3b zülalından və altı kodlaşdırmayan RNT-dən ibarət, altı eyni monomerdən ibarət olan simmetrik heksamerə — molekula — bağlı sıx şəkildə təşkil olunmuş bir varlıq olduğunu ortaya qoydu.

Bakterial müdafiədə istifadə edilən yeni kəşf edilmiş zülal şablonlu yol biotexnologiya və tibb üçün bakteriyaların mühəndisliyi üçün yeni yollar aça bilər. Bunun üzərində işləmək üçün gələcək tədqiqatlar sintez edilmiş DNT-nin virus işğalını necə pozduğunu aşkar etməlidir.

Müəllifimiz Sanjukta Mondal tərəfindən sizin üçün yazılmış, Sadie Harley tərəfindən redaktə edilmiş və Robert Egan tərəfindən faktlar yoxlanılmış və nəzərdən keçirilmişdir — bu məqalə diqqətli insan əməyinin nəticəsidir. Müstəqil elmi jurnalistikanı yaşatmaq üçün sizin kimi oxuculara güvənirik. Bu reportaj sizin üçün vacibdirsə, xahiş edirik ianə etməyi düşünün (xüsusilə aylıq). Təşəkkür olaraq reklamsız hesab əldə edəcəksiniz .