Vaterloo Universiteti tərəfindən

Lisa Lock tərəfindən redaktə edilib , Robert Egan tərəfindən nəzərdən keçirilib

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Sintetik modifikasiya olunmuş peptidlərdən istifadə edərək açıq PTM axtarışı üçün RNovA-nın müqayisəli modulları. Kredit: Nature Biotechnology (2026). DOI: 10.1038/s41587-026-03116-1

Yeni bir alqoritm xərçəng, Alzheimer xəstəliyi və digər potensial ölümcül xəstəliklərin anlaşılmasında irəliləyişlərə səbəb ola bilər. Vaterloo Universitetinin tədqiqatçıları insan hüceyrələrindəki zülallardakı dəyişiklikləri aşkar etmək üçün RNovA adlı maşın öyrənmə alqoritmi hazırladılar. Onların tədqiqatı Nature Biotechnology jurnalında dərc olunub .

Zülallar hüceyrələrin içərisində çox iş görür və onlar əmələ gəldikdən sonra bədənimiz onları bir çox cəhətdən kimyəvi cəhətdən dəyişdirə bilər. Posttranslyasiya modifikasiyaları və ya PTM kimi tanınan bu dəyişikliklər bir çox hüceyrə funksiyalarının tənzimlənməsinə kömək edir. PTM-lərdəki dəyişikliklər bir çox ciddi xəstəliklərlə əlaqələndirilir.

“Bioloji nümunələrdə PTM-lərin müəyyən edilməsi bahalı və texniki cəhətdən çətindir”, – deyə kompüter elmləri üzrə doktorluq namizədi və tədqiqatın aparıcı müəllifi Zeping Mao bildirib. “Bu, ənənəvi olaraq kütləvi spektrometrlər kimi avadanlıqlardan istifadə edərək laboratoriyada həyata keçirilir. Alqoritmdən istifadə daha sürətli və daha ucuzdur.”

PTM-ləri müəyyən etmək üçün mövcud metodlar, tədqiqatçılar istinad protein verilənlər bazasına, əvvəlcədən müəyyən edilmiş dəyişikliklər siyahısına və ya etiketlənmiş təlim məlumatlarına müraciət etdikdən sonra nə axtardıqlarını artıq bildikdə ən təsirli olur.

Mao dedi: “Əgər dəyişiklik nadir, gözlənilməz və ya verilənlər bazasında yoxdursa, mövcud metodlar onu görməzdən gələ bilər. Bu, bir tapmacanı həll etməyə çalışmaq kimidir, amma yalnız bir neçə parçanı görə bilirsən.”

RNovA, verilənlər bazalarında olmayan yeni PTM-ləri tez və dəqiq müəyyən edə bilər. Bu o deməkdir ki, model hər yeni PTM üçün yenidən təlim keçmədən və əvvəlcədən müəyyən edilmiş PTM-lərin siyahısından başlamadan gözlənilməz dəyişiklikləri aşkar edə bilər.

Komanda ümid edir ki, bu kəşf diaqnostikada irəliləyişlərə gətirib çıxaracaq və eyni zamanda əsas bioloji tədqiqatlarda maşın öyrənməsinin imkanlarını genişləndirəcək.

Mao bildirib ki, “PTM siyahısının genişləndirilməsi tədqiqatçılara yeni hüceyrə modifikasiyaları və xərçəng və digər xəstəliklər üçün yeni markerlər tapmağa kömək edə bilər. Bu, bioloqların üfüqlərini genişləndirməsinə kömək edəcək çox güclü bir vasitədir.”

Nəşr detalları

Zeping Mao və digərləri, Açıq posttranslyasiya modifikasiyası kəşfi ilə sıfır-şot de novo peptid ardıcıllığı, Nature Biotechnology (2026). DOI: 10.1038/s41587-026-03116-1

Jurnal məlumatları: Təbiət Biotexnologiyası 

Əsas anlayışlar

Hüceyrə quruluşu, fiziologiyası və dinamikasıBioinformatika

Vaterloo Universiteti tərəfindən təmin edilir