Polşa Elmlər Akademiyasının Fundamental Texnoloji Tədqiqatlar İnstitutu tərəfindən

redaktə edən: Gaby Clark , rəy verən: Robert Egan

 Redaktorların qeydləri

 GIST

Tercih edilən mənbə kimi əlavə edin

Bu vizuallaşdırma, GōMartini 3 simulyasiyalarında virtual AFM-SMFS vasitəsilə antikorla əlaqəli SARS-CoV-2 sünbül zülalının mexaniki olaraq zondlandığını və qüvvə ilə idarə olunan dissosiasiya yollarını və molekulyar mexaniki reaksiyaları aşkar etdiyini göstərir. Mənbə: Şəkil Adolfo B. Poma və Gustavo E. Olivos-Ramírezin icazəsi ilə Fiziki Kimya Kimya Fizikasından , 2026, 28, 8997-8997-dən təkrarlanıb.

Beynəlxalq tədqiqat qrupu antikorların SARS-CoV-2-ni necə neytrallaşdırmasına təsir edən əvvəllər nəzərdən qaçırılmış bir amili müəyyən edib: onların güc tətbiqi altında mexaniki stabilliyi. Antikorlar immun sisteminin virus hissəciklərinə bağlanan və infeksiyanı bloklayan əsas komponentləridir. Ənənəvi olaraq, onların effektivliyi yalnız bağlanma yaxınlığına – virus zülallarına nə qədər güclü bağlandıqlarına əsasən qiymətləndirilib. Lakin insan bədənində antikorlar qan axını, tənəffüs hərəkəti və hüceyrə qüvvələri ilə formalaşan mexaniki dinamik mühitdə fəaliyyət göstərir.

“Fiziki Kimya Kimya Fizika” jurnalında dərc olunmuş bir araşdırmada tədqiqatçılar antikor-virus komplekslərinin orijinal 2019 ştammı və BA.4 və JN.1 omikron subvariantları da daxil olmaqla bir çox SARS-CoV-2 variantında mexaniki qüvvələrə necə reaksiya verdiyini araşdırmaq üçün qabaqcıl kompüter simulyasiyalarından istifadə ediblər. Komandaya Dr. Adolfo Poma (Fundamental Texnoloji Tədqiqatlar İnstitutu, Polşa Elmlər Akademiyası — IPPT PAN, Varşava) rəhbərlik edib və Dr. Luis Fernando Cofas-Vargas (Universidad Autónoma Metropolitana-İztapalapa, Meksika) və Prof. Siewert J. Marrink (Qroningen Universiteti, Hollandiya) ilə əməkdaşlıq edib.

Komanda ənənəvi Y formalı antikorları nanocisimlərlə — əvvəlcə dəvələrdə, məsələn, lamalarda kəşf edilmiş daha kiçik, tək domenli zülallarla müqayisə etdi. Nanocisimlər sabitliyi və kompakt quruluşlarına görə terapevtik namizəd kimi getdikcə daha çox öyrənilsə də, antikorların iki bağlanma qolu olduğu üçün daha güclü bağlana bilər.

Simulyasiyalar göstərdi ki, ənənəvi antikorlar mexaniki yükü qeyri-bərabər paylayır: ağır zəncir qüvvənin böyük hissəsini daşıyır, yüngül zəncir isə struktur möhkəmləndirməsini təmin edir. Birlikdə onlar təxminən 500 pikonevton qüvvələrinə müqavimət göstərə bilən kooperativ sistem təşkil edirlər. Əhəmiyyətli olan odur ki, toxunulmamış antikor strukturu mexaniki cəhətdən fərdi komponentlərindən daha güclüdür, çünki hər iki zəncirin çıxarılması sabitliyi əhəmiyyətli dərəcədə azaldır.

Tədqiqat həmçinin göstərir ki, virus mutasiyaları yalnız bağlanma yaxınlığına deyil, həm də mexaniki müqavimətə təsir göstərir. BA.4 variantı bir neçə antikor-virus kompleksinin mexaniki stabilliyini artırmağa meyllidir, JN.1 variantı isə azalmış stabilliklə əlaqələndirilir ki, bu da SARS-CoV-2 təkamülünün mexaniki və biokimyəvi təzyiqlərə uyğunlaşma ilə əlaqəli ola biləcəyini göstərir.

Bir neçə halda, mexaniki qüvvələr antikor ayrılması zamanı virus sünbül zülalının müəyyən bölgələrinin qismən açılmasına səbəb olur. Bu mexaniki cəhətdən həssas sahələr gələcək terapevtik dizayn üçün perspektivli hədəflər ola bilər.

Doktor Adolfo Poma bildirib ki, “Nəticələrimiz göstərir ki, antikor effektivliyi yalnız bağlanma affinliyi ilə tam başa düşülə bilməz. Mexaniki sabitlik fizioloji şəraitdə mühüm rol oynayır və gələcək terapevtik dizaynda nəzərə alınmalıdır.”

Bu tapıntılar həm biokimyəvi, həm də mexaniki perspektivləri birləşdirən antikor mühəndisliyi üçün yeni bir dizayn prinsipi təqdim edir. Bu yanaşma SARS-CoV-2 və xərçəng də daxil olmaqla, antikor əsaslı müalicələrin istifadə edildiyi digər xəstəliklərə qarşı terapevtik strategiyaları təkmilləşdirə bilər.

Tədqiqat jurnalın üz qabığında yer almışdı.

Nəşr detalları

Luis F. Cofas-Vargas və digərləri, SARS-CoV-2 variantlarına antikor və nanocismin bağlanmasının müqayisəli nanomekanik tədqiqi, Fiziki Kimya, Kimya Fizika (2026). DOI: 10.1039/d6cp00556j

Jurnal məlumatları: Fiziki Kimya Kimyəvi Fizika 

Polşa Elmlər Akademiyasının Fundamental Texnoloji Tədqiqatlar İnstitutu tərəfindən təmin edilib